牙根尖囊肿手术没有什么风险的，牙根尖囊肿是由根尖肉芽肿或者是慢性牙槽脓肿发展而来的一种牙科疾病，会出现局部肿胀、疼痛等症状，如果囊肿较大，可以进行手术切除，是一种很简单的手术。
根尖周炎手术通常不痛。
尖周炎是发生在牙根尖周组织的炎症性疾病。如果是急性化脓性根尖周炎，有明显化脓，有脸肿，就需要做脓肿切开术。脓肿切开术会有一定的疼痛，有的患者会感觉到疼痛，有的患者会感觉到疼痛。为了减轻疼痛，最好是局部麻醉药物进行局部阻滞麻醉，或者表面麻醉药物进行表面麻醉，然后进行脓肿切开引流。
根尖周囊肿需要手术，具体内容分析如下：
根尖周囊肿是颌骨内常见的牙源性囊肿，常与死髓牙相连，有叩击痛，平均直径1-2mm，一般需要手术。当它变大时，下颚会膨胀。首先要对死髓牙进行处理。去除坏死牙髓、消毒根管后，完成根管充填。在患牙颊侧根尖处的牙龈上做一个T形切口，翻瓣，暴露牙槽骨表面，用球钻缓慢研磨牙槽骨，暴露囊肿，完全切除，用刮匙刮除周围肉芽组织和病变牙槽骨，必要时切除部分根尖，缝合伤口。
如果根管治疗减菌不完全、牙套材质不良，或密合度不佳，都有可能导致牙根里头持续发炎、化脓的牙根间囊肿，如果不及时治疗，通常牙齿內的細菌會慢慢侵蚀，甚至从一颗牙根传染到另一颗牙根。牙根里发炎、化脓，暗藏许多细菌，才会导致疼痛，忽视的結果可能会造成蜂窝性组织炎，严重甚至扩大感染。
慢性根尖周炎通常会出现根尖周组织的大规模损伤、肉芽肿、脓肿、囊肿等症状，因此，单纯用根管疗法难以彻底清除或彻底的感染，需要进行根尖的局部摘除手术和根尖搔刮手术。只要不是严重的系统性病变，可以承受外科手术，患者就可以在医院进行外科手术，而对于一些严重的全身性病变，则需要进行外科手术。患者要积极配合医生进行处理。
如果是没有任何的症状，可以进行继续观察变化，一旦出现症状或者持续性增长的情况，就需要考虑进行手术治疗，使用药物进行保守治疗一般是没有效果的。多注意休息时间的合理安排。
