一般来说，神经系统发育不良以下方式治疗最好。具体分析如下：
如果出现了神经系统的异常可能是先天的发展缺陷。如果大脑皮质发生了异常，就会有可能发生癫痫，而病情较重的病人会出现智力缺陷，患者可以通过服用促进大脑的新陈代谢以及促进血液循环，比如比拉西坦、奥拉西坦、胞二磷胆素等。
家长应该让患儿多吃含钙丰富的食物，如奶制品、豆类、豆制品等，注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，适当运动。
通常情况下，脑发育不良可以进行健脑补肾治疗，一般可以可以给儿童使用安神补脑液、补肾地黄丸，都可以良好的帮助大脑发育。其次还可以给儿童使用优甲乐来治疗，因为脑发育不良可能是甲状腺分泌不足导致的。
另外，还可以艾灸儿童的足三里穴、肾腧穴；艾灸足三里穴一般可以起到健脾作用，而艾灸肾腧穴，一般可以起到补肾的作用，当脾肾功能充足后，脑发育不良的情况可以得到明显的改善。
一般来说，软骨发育不良应该采取以下方式进行治疗。
出现软骨发育不良的情况，患者可以遵医嘱口服钙尔奇类钙剂、氨糖类药物进行治疗，起到促进软骨修复的作用。必要时，患者可以通过关节镜下用髓内钉进行微创手术治疗，从而帮助修复。如果是染色体显性遗传引起的，可以适当应用生长激素进行治疗。必要时，可以做截骨手术达到根治的目的。
阴茎发育不良怎么治疗最好，需要视情况而定。如果是在青少年时期、未成年之前出现阴茎发育不良，一般可以通过外源性地补充雄性激素，促进男性阴茎的发育，可以肌肉注射绒毛膜促性腺激素，或者口服安特尔。如果是成年人，一般可以使用药物治疗或者其他的方式一般效果都不好。建议可以采用手术的方式，最常见的就是阴茎延长手术，或者通过阴茎海绵体假体植入手术。
一般情况下，大脑的发展可能会造成儿童的智商下降，严重的还会造成肢体动作和言语能力下降。在所有的智力缺陷患儿中，大约四分之一的智力是正常的，大约1/2的智力是轻度和中度的，1/4的是中度智力的。对于轻微的脑发展不良，可以通过饮食和药品结合进行调理，平时可以多食用一些益气活血、健髓益智的食品，比如核桃仁、牡蛎、深海鱼等。在药物方面可以选择一些药物，比如维生素E、甲钴胺等，可以促进大脑血液循环，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
孩子髋关节发育不良，首选支具治疗，主要指征是存在脱位，并且通过试验可以复位的病人，使用支具之后，2-3周需要超声检查，6周之后可以去除支具，再次复查。如果关系良好，要求密切观察；如果复位不稳定，可以继续使用支具到关节稳定。
