一般情况下，妊娠妇女都会使用一些抗菌药物来治疗疾病，如青霉素类、头孢菌素等。
抗生素对细菌性结膜炎有优良的疗效，对病毒性结膜炎的治疗虽然无效，但还有防止细菌感染。在怀孕期间，由于胎儿的不断发育，身体抵抗力会越来越弱，很容易受到病菌和病毒的侵害而引起炎症，导致眼部发炎或视力下降等症状。因此，孕妇患结膜炎的话，眼药水和眼药膏都要专人专用。另外，在用药时要注意避免使用刺激性药物和激素类眼药品种，因为激素有刺激眼部黏膜和结膜细胞生长等不良反应。
孕妇一般是不建议使用眼药水的。
眼药水进入体内浓度值比较低，但是通过胚胎会对胎儿产生一定的危害。虽是局部用药，如抗生素类氯霉素滴眼药，但氯霉素对骨髓抑制功效比较大，有一些眼药水孕妈妈用后仍然会对胎儿造成明显负面影响。四环素类易导致胎儿畸型，左氧四星眶可导致胎儿骨关节疾病。
怀孕期间注意戒酒，咖啡，茶等含有咖啡因和酒精的饮品，避免腌制，熏制的食物。
雾化一天做两次就可以，上午8-9点和下午15-16点做。雾化治疗只是一种辅助治疗，所以不是做得越多越好。咳嗽、气管、支气管炎时可以用雾化吸入治疗，如果痰液黏稠难以咳出，可以加用糜蛋白酶、沐舒坦、生理盐水。为了防止对蛋白酶过敏并减轻急性炎性反应，一般还加入地塞米松，雾化后最好20-30分钟后再饮水吃饭。
可以使用眼药水，但不要盲目使用一些眼药水，这可能会导致相反的效果。如果孩子的眼睛非常干燥，这可能与眼睛使用不当或饮食中火的重量过大有关。可以在眼睛上热敷以避免长期使用。平时，应该补充更多富含维生素A的蔬菜和水果。如果效果不好，带孩子去眼科医院，在指导下使用眼药水。
托百士眼药水婴儿是可以使用的。托百士眼药水属于氨基糖苷类抗生素滴眼液，在其临床试验中显示，妥布霉素能安全有效的应用于儿童病人，是儿童专用眼药水，不良反应和副作用较小。此药主要适用于外眼和附属器敏感菌株感染的局部抗感染治疗，可以治疗新生儿结膜炎、淋球菌性、结膜炎、新生儿泪囊炎、泪道堵塞、角膜炎等多种眼表疾病。
儿童眨眼通常应对症用药。
儿童眨眼的原因有很多，比如角膜炎，结膜炎，屈光不正，倒睫，干眼症等，需要到医院眼科面诊检查，明确原因后才能有针对性的用药，例如针对角膜炎和结膜炎需要使用抗感染的药物，对于倒睫与结膜结石造成的，需要去掉，屈光不正造成的需要佩戴眼镜。儿童可以按照医嘱使用伏立康唑片、氧氟沙星滴眼液、氟康唑胶囊等药物进行治疗。