口腔溃疡可以通过药物进行治疗。口腔溃疡的治疗方法主要是祛除病因、增强体质、对症治疗，坚持全身治疗与局部治疗相结合，心理治疗与生理治疗相结合。口腔溃疡的局部可以使用喷雾剂或者西瓜霜局部适量的外用，同时要祛除口腔内的不良刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体等。还要注意保持口腔清洁，每日正常刷牙、漱口，多吃水果、蔬菜，保证机体所需要的营养及微量元素。还要注意心理健康，时刻保持心情愉悦，不能有过大的心理负担。一般情况下，一周左右口腔溃疡即可愈合。建议去口腔科进行检查，根据诊断结果对口腔溃疡进行治疗。日常生活中应该注意口腔的保养，多吃一些清淡的食物，防止上火。
对于口腔溃疡，中医要对症治疗，调节免疫力平衡，提高机体自身免疫力是治疗疾病的关键所在。中西医结合辨证施治依据个人体质所独特配制的纯中药方剂，通过内外兼治，提高免疫力，筑起人体的防预屏障，从而有效的抵御细菌和病毒侵入，发挥对细胞免疫功能的调节作用，增加免疫球蛋白的数量，平衡五脏六腑的功能，提高机体自身免疫力，从源根上有效治疗口腔溃疡。
首先可能是受到饮食因素的影响，饮食不规律，经常食用一些油炸辛辣刺激性的食物，则会在一定程度上大大增加了机体口腔溃疡疾病的发生。缺乏必要的维生素，也有可能会导致这一情况的发生。维生素的缺乏容易导致机体出现有口腔溃疡疾病，要多吃富含维生素B1、B2、C的新鲜蔬果，另外可以补充一些微量元素锌，这些都是有助于溃疡面愈合的食物，对防治口腔溃疡也有好处。
用消毒棉签蘸粉末敷患处，一般用药3天后恢复，将维生素C研成粉末状，若系小溃疡，仅需取少许敷于患处即可，若溃疡面较大，则应先轻轻刮除溃疡面渗出物，然后再敷药粉，用针刺破维生素E，将药液挤出涂于口腔溃疡处，保留1分钟，每日用药4次可恢复。
口腔溃疡的治疗方式根据其症状轻重，有所不同。轻型或普通型的溃疡患者以局部药物为主，症状较重的患者则需在局部用药的同时，配合止痛、免疫调节功效类药物对症治疗。
口腔溃疡的药物剂型主要可分为含漱液、贴片、含片等类型，在这之中，贴片具有精准给药、用药便捷的优势。醋酸地塞米松作为激素药物，能够有效减轻因炎症反应中释放的物质刺激粘膜带来的疼痛，如意可贴醋酸地塞米松口腔贴片，其所含药物剂量可在人体安全代谢，可发挥较好的抗炎抑菌疗效，轻症及普通型患者可优先选择这类局部药物治疗。
如果疼痛症状较重，可遵循医师建议联用止痛制剂治疗。当复发频率较高时，还可配合匹多莫德口服液、维生素C片等药物提高免疫，改善身体抗病能力。期间建议以温热清淡的流食或半流食为主，不要吃油腻辛辣及生硬食物，否则可能会造成溃疡刺激加重，不利于尽快愈合。
患有口腔溃疡和身体里面所缺维生素有一定的关系，患有口腔溃疡的情况下是可以吃鸡蛋的，只是不要吃辣椒炒鸡蛋，否则会导致口腔溃疡更加严重，一定要注意多饮水，因为多饮水能够有一定的缓解效果，还要注意多食用一些含有维生素的蔬菜和水果。