上尿路结石是指肾脏和输尿管的结石，小结石落入输尿管后会刺激输尿管引起痉挛，从而出现腰部剧烈疼痛，部分病人会伴有血尿、恶心、呕吐症状。如果是比较大的结石堵塞了肾盂或者输尿管，引起了完全性的梗阻会产生肾积水，甚至是感染，病人会有腰部酸胀疼痛感，部分病人会出现发热、寒战等表现。
女性尿道结石症状最常见的就是疼痛，一般是突发尿道疼痛和排尿痛，疼痛会向尿道口及会阴部或者直肠放散，如果结石合并感染，会出现膀胱刺激症状和脓尿，会有尿频、尿急、尿痛以及终末血尿，结石堵塞尿道嵌顿会导致排尿困难，不能自己排尿，如果结石嵌顿不明显，就会有尿线变细，尿流滴沥，排尿困难，严重导致膀胱尿潴留，由于结石是突然嵌进尿道内，病人多突发排尿突然中断，有强烈尿意但不能排尿。
尿路结石根据结石位置不同症状也不同，肾结石没有腰腹部疼痛症状，会有尿频、尿急、尿痛等泌尿系感染症状，镜下偶尔可以发现血尿。如果引起感染可以出现发热。输尿管结石都会引起肾绞痛，恶心、呕吐。同时发热、尿频、尿急、尿痛症状严重。会有镜下血尿。膀胱结石会出现尿流中断典型症状。泌尿系感染症状较重。多数出现排尿困难。
尿道结石大部分都伴有疼痛、血尿、或者是排尿困难。如果是输尿管下段的结石，可能会有频繁的便意，还有频繁的想去小便，但是小便又没有多少尿的感觉。膀胱结石没有什么大的症状，可能会有一些血尿，或突然出现尿流中断。
结石发生的部位不同，所引起的症状也不同。肾结石通常没有明显的症状，可以伴有活动时尿血，输尿管结石出现剧烈的腹痛和腰痛，常伴有恶心、呕吐等消化道症状，也可以伴有尿频、尿急、下坠以及小腹不适等症状，可以伴有血尿。膀胱结石表现在排尿的过程中，尿流的突然中断，同时伴尿道口放射的疼痛，以及尿道口流血。尿道结石是尿路结石在排出的过程中卡于尿道所致。在尿道局部可以摸到结石，伴有疼痛和尿血。