移植入宫腔的胚胎有时会随培养液流入输卵管，当输卵管功能正常时，能将胚胎在运送回宫腔，但当输卵管和盆腔病变后，输卵管正常蠕动消失，就不能将胚胎运送回宫腔，就会发生宫外孕。此外做试管婴儿时，如果胚胎质量差、移植胚胎数目多、患有子宫内膜异位症等都会导致宫外孕发生率增高。
试管婴儿宫外孕是因为胚胎移植到宫腔内，可能会在宫腔游离一段时间才能找到合适的着床部位进行着床，如果在游离的过程中跑到了输卵管内，就有可能在输卵管处生长发育，形成宫外孕，但可能性是非常小的。
两侧输卵管都有过宫外孕做试管婴儿其实也是可以的。试管是在体外受精完之后，再放到子宫内进行发育，还是会有一些并发症出现的，也会有一个比较大的一个风险，所以要进行一个彻底的检查。
做试管婴儿也不是一定不会有宫外孕，做试管婴儿也有可能有宫外孕的现象，所以在做试管婴儿之前一定要注意自己身体的检查，身体符合条件以后再进行手术，但是试管婴儿成功率不是很高。
早期宫外孕，可无任何自觉症状，偶可反应为阴道不规则出血，伴下腹轻微不适。化验血HCG值48小时不能翻倍生长，孕酮小于15ng/mL。当血HCG高于5000mIU/mL时，彩超提示宫腔内仍未见到妊娠囊，需高度警惕为宫外孕。
试管婴儿宫外孕的几率是相等的，输卵管结扎了就不会宫外孕，做近端结扎。如果把输卵管近端都结扎了就不会发生宫外孕，做试管婴儿的成功率就更高了。试管婴儿的宫外孕发生率比较其输卵管复通术后的宫外孕发生率还要高。
