甲状腺球蛋白抗体大于1000可以通过饮食调理、药物治疗等方式进行治疗，具体分析如下：
甲状腺球蛋白抗体大于1000表面指数偏高，甲状腺球蛋白抗体指数的上升在自身免疫性甲状腺疾病中是常见的。最常见的是桥本甲状腺炎，有些甲状腺功能亢进症的病人也会出现增高的情况，要结合甲状腺功能和彩超来判断。如果只是单纯的增加，一般不需要特殊治疗，但是桥本甲状腺炎会导致甲状腺功能下降。如果是甲状腺功能亢进症，可以考虑使用抗甲状腺功能亢进的药物。桥本甲状腺炎的发生，与高碘饮食有一定的关系，因此，无论甲状腺功能亢进症或桥本甲状腺炎，都要适度地控制食用海鲜和碘盐。
应该尽早到正规医院进行甲状腺超声检查和甲状腺素化验检查，查清病因，在医生的指导下进行治疗。平时避免剧烈运动，不要吸烟与喝酒。甲状腺球蛋白抗体升高有可能是慢性甲状腺炎的表现。
甲状腺球蛋白抗体升高，未累及甲状腺功能时，只随访，即定期复查。
甲状腺功能、甲减者需替代治疗左甲状腺激素。抗体升高多表现为桥本甲状腺炎和弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症，这两种疾病多由自身免疫引起，桥本甲状腺炎仅表现为抗体升高。抗体升高未累及甲状腺不需要治疗，累及甲状腺功能低下者，可用左甲状腺激素替代治疗。一般来说，从少量开始，逐渐加入到完全可以替代的量。替代治疗后需终生服药，应仔细检查甲状腺功能。
饮食控制，出现甲状腺球蛋白抗体偏低的情况以后，在饮食方面一定要少吃高脂肪，辛辣刺激性的食物，同时可以多补充一些高蛋白质的食物。多进行运动锻炼，比如每天晚上睡觉之前就可以出去小跑10分钟左右，通过运动来提高个人的免疫力。
在孕期最容易体内激素水平紊乱的。如果是单纯的。甲状腺球蛋白抗体偏高。促甲状腺素的值不超过2.5。应该没有什么问题。如果促甲状腺素值。超过2.5。就应该到内分泌科看一下。一般来说不会影响到胎儿的。但是需要注意定期检查的。
孕妇抗甲状腺球蛋白抗体水平过高一般不需要药物治疗。
抗体水平过高是否影响甲状腺激素水平很重要。特别是甲状腺激素水平，如果甲状腺激素水平过高，会在一定程度上影响胎儿的智力发育，因此有必要观察甲状腺激素的三个检测结果。孕妇抗甲状腺球蛋白抗体水平较高，但检测甲状腺功能提示促甲状腺激素水平低于2.5mU/L，无需介入治疗。相反，测定促甲状腺激素水平超过2.5mU/L甚至超过4mU/L时，应给予口服优甲乐干预治疗，尽量使促甲状腺激素水平降至2.5mU/L，对胎儿发育尤其是智能发育效果明显。