根据患者甲状腺多发胶质囊肿的体积、大小、具体性质和患者是否伴有明显临床症状等因素，往往采取不同的处理方法。具体如下：
1、甲状腺多发胶质囊肿体积相对较小时，囊肿没有压迫局部神经血管或重要脏器。彩超提示囊肿边界清晰，回声均匀，无明显恶性肿瘤征象。可定期进行甲状腺彩超检查，仔细观察囊肿变化情况，暂时无需特殊处理。
2、甲状腺多发胶质囊肿体积大，压迫至患者喉返神经、气管、食管，患者出现一定程度的声嘶、呼吸困难，彩超检查提示囊肿纵横比大于1，且有明显血流信号等恶性肿瘤征象。此时多发性胶质囊肿病情较严重，需及时手术治疗。
近年来，随着生活水平、节奏、压力的增高，发现甲状腺结节的人越来越多，多为甲状腺胶质囊肿，超声下表现为囊性结节，中间可见称为胶质晶体的亮点。这类疾病不需要特别的治疗。其实是生理状态的反应，所以不需要太多的医疗干预。但是，超声波诊断多被解释为结节内的钙化灶，有时会被误认为是甲状腺恶性肿瘤。
因此，对于甲状腺神经胶质囊肿，首先要做出正确的判断，如果确定甲状腺神经胶质囊肿不予治疗，只需给予临床观察。对于甲状腺胶质囊肿，患者应减轻心理压力，在此过程中主要定期观察。胶质囊肿生长缓慢，每年行一次超声检查即可，如无增大趋势，生活方式调整有缩小趋势，可能消失，为可逆性病变。
甲状腺囊肿多为良性。甲状腺癌合并囊肿少见，约1%~2%，癌性囊肿、囊液细胞学检查通常可见癌细胞。曾用手术治疗甲状腺囊肿，多切除囊肿。
手术操作造成的骨肿瘤疤痕，影响美观，有一定的并发症。目前多主张穿刺抽取和注射硬化剂治疗。这些固化剂能使囊壁发生无菌性坏死，阻止囊肿生成，使囊壁粘连，达到治疗纤维化、囊肿堵塞、囊肿的目的。该治疗对薄壁囊肿效果最好，有效率达94%。厚壁囊肿疗效差。厚壁囊肿实变肿块与周围组织无明显边界，囊肿内容物血性，反复抽吸后快速积聚，应警惕癌变可能，宜采用手术治疗。术中病理活检为恶性肿瘤，按甲状腺癌处理。
双侧甲状腺多发囊肿的治疗方法如下：
一、甲状腺多发囊肿体积相对较小时，囊肿没有压迫局部神经血管或重要脏器。彩超提示囊肿边界清晰，回声均匀，无明显恶性肿瘤征象。可定期行甲状腺彩超检查，仔细观察囊肿变化情况，建议患者暂时无需特殊处理。
二、甲状腺多发囊肿体积大，压迫至患者喉返神经、气管、食管，患者出现一定程度的声嘶、呼吸困难，彩超检查提示囊肿有纵横比大于1且明显血流信号等恶性肿瘤征象。此时多发性囊肿病情较严重，建议患者及时治疗手术。
目前甲状腺囊肿出血的唯一有效治疗方法是甲状腺的手术治疗，其他方法一般无效。
甲状腺囊肿出血一般为良性病变，患者无需过于紧张和担心，只要经过规范的手术治疗即可治愈。患者经过手术后，可能需要长期或终生口服左甲状腺激素片进行替代治疗。另外，还需要补充适量的钙片和维生素d，以防止低钙血症的发生。患者进行手术后，必须保持切口敷料干燥，勤伤口换药。如果患者有糖尿病，必须控制血糖。
临床上，根据患者甲状腺多发性囊肿的体积、大小，根据囊肿的具体性质和患者是否伴有明显临床症状等因素，往往采取不同的处理方法：
一.甲状腺多发囊肿体积相对较小时，囊肿没有压迫局部神经血管或重要脏器。彩超提示囊肿边界清晰，回声均匀，无明显恶性肿瘤征象。可定期行甲状腺彩超检查，仔细观察囊肿变化情况，建议患者暂时无需特殊处理。
二、甲状腺多发囊肿体积大，压迫至患者喉返神经、气管、食管，患者出现一定程度的声嘶、呼吸困难，彩色多普勒检查提示囊肿有纵横比大于1且明显血流信号等恶性肿瘤征象。此时多发性囊肿病情较严重，建议患者及时治疗手术。
