精子畸形率越高，导致许多男性不育的可能性也越高，意味着受孕机率的降低，但与胎儿畸形并无明确相关性，畸形精子症并不一定会导致胎儿畸形。因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，精子在穿过女性生殖道的过程中会将大部分畸形精子淘汰掉，从而排除了畸形精子和卵子结合的可能，最终保证受孕的精子的质量。
精子畸形率高怀孕能保证宝宝不受影响，多锻炼身体，不要吸烟喝酒。人的精子三个月循环一次，所以希望能坚持三个月的锻炼身体。和吃番茄红素、维生素E三个月就能有所改善。
相对而言，同卵双胞胎畸形发生率要高于单胎。
胎儿在子宫内需要母体提供的羊膜囊和胎盘。同卵双胞胎是由一个受精卵在子宫内着床，分裂成两个细胞而发育形成。双胞胎尤其是单绒毛膜性双胎，如果出现两个胎儿共用一个胎盘的情况，容易发生双胎输血综合征，导致胎儿生长受限。如果两个胎儿在一个羊膜囊内，则容易发生脐带交锁，导致胎儿死亡。单胎则是一个胎儿使用一个羊膜囊和胎盘，不会发生上述情况。
因此在确认胚胎为同卵双胞胎之后，孕妇应及早对双胞胎的人绒毛膜性进行检查，方便之后的孕检。孕妇可以在怀孕12至14周进行nt检查，15到20周进行唐氏综合征的筛查，20周以后进行大排畸检查，必要时可以做无创DNA检查。
男性精子畸形率高，是可以做试管婴儿的，比较适合做二代试管婴儿。但是考虑试管婴儿手术费用非常高，成功率却不是很高，因此还是先去正规专业医院查清导致精子畸形率高的原因，然后对症治疗。如果治疗效果不好，再考虑做试管婴儿。
如果精子畸形率很高，及时到医院治疗，不要担心太多，可以使用一些神经药物来改善。同时，患者必须采取更多的户外活动，提高免疫力，戒烟，吃黑豆，黑芝麻，黑米，黑木耳，牛肉，羊肉，加强身体，性生活不应太频繁。
精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。具体分析如下：
精子畸形是指正常男性精子的头、体、尾部出现变异形态，通常是由精索静脉曲张、精子在附睾发育障碍、生殖道感染等因素导致的。该情况可能会降低精子的活性，从而影响受精功能，使精子、卵子的结合能力降低。但是胎儿畸形一般是指胎儿在子宫内发生的结构或染色体异常，也就是精子和卵子在进行受精之前存在遗传物质异常，在受精之后出现基因突变等现象。所以，精子畸形率高不一定会导致胎儿畸形。