肝内胆管结石不能自愈，需要系统进行医学治疗，多继发于胆道系统感染或者有胆道蛔虫的病史，以及外伤之后导致的胆管损伤，或者先天性发育异常，有解剖胆管变异，容易导致胆汁淤积，继发形成结石。
胆管结石是肝胆外科中的常见疾病，不一定需要手术治疗。如果结石较小，没有明显的腹痛或腹痛发作次数较少，可以使用一些抗炎和清热解毒药物进行治疗。如果结石相对较大，通常会导致右上腹绞痛、寒战、高烧、黄疸等。进行外科治疗。
胆管结石不严重，考虑胆管结石引起腹痛恶心呕吐不适情况，可以注意休息避免剧烈活动劳累，注意饮食清淡规律，忌辛辣刺激生冷油腻食物，可以考虑当地正规综合性医院普外科就诊b超检查看看，较小胆管结石应用一些排石利胆药物治疗观察。
一般情况下，肝胆管结石可分为肝内结石、肝外结石等，患者应对症进行治疗，具体内容如下：
1.肝内结石：如果患者患有肝胆管结石，并且为肝内结石，但结石体积较小，未引起梗阻，通常不用特别进行治疗。但是，如果肝内结石体积较大，并出现了胆管阻塞的情况，则需要通过手术治疗来去除结石。
2.肝外结石：如果患者体内存在肝外结石，可以通过内镜治疗、手术治疗等方式来进行治疗，以去除患者体内的结石，促进患者身体恢复健康。
在日常生活当中也应该远离高胆固醇的食品和高脂肪食物。因为这些食物也容易诱发肝内胆管或者胆总管结石的形成。并且也应该以清淡容易消化的食物为主，多吃粗纤维食物也有利于肠道蠕动。同时也应该定期进行复查，远离烟酒环境，不能暴饮暴食，适当进行体育功能锻炼，平时也应该多喝水。
可以采用无创保肝取石，在ERCP内镜的基础上研制出的一种高新胆管内镜系统，在ERCP内镜基础上，采用十二指肠大乳头球囊扩张胆管出口，将ERCP纤维内镜送入胆总管内，通过胆总管直达肝内胆管，通过肝内胆管球囊扩张肝内胆管，扩开肝内胆管内径，通畅取石通道，可以一次性彻底清除肝内胆管结石，手术全程在视频可视下内镜操作，无痛、无创伤、无出血，一次彻底治愈肝内胆管结石，保住正常的肝脏组织。