前列腺囊肿通过跑步不可以自愈。囊肿形成的原因有，胚胎期时前列腺腺体发育受阻，中肾导管与中肾旁管发育异常，坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻，使腺泡上皮变厚，引起潴留性囊肿。炎症性囊肿前列腺慢性炎症引起结缔组织增生，导致前列腺导管狭窄、分泌物潴留形成囊肿。寄生虫性囊肿寄生虫引起前列腺管及周围发生慢性炎症；或由肉芽增生，逐渐形成囊肿。具体需要根据原因和囊肿的大小进行治疗。
可以适当跑步，前列腺囊肿临床表现排尿梗阻或大便梗阻，排尿梗阻常会引起急性尿潴留。前列腺囊肿有时从尿道流出浓性分泌物，指肛检查可触及前列腺有波动感，但前列腺囊肿常在后期方出现。前列腺囊肿偶有破入尿道、直肠、会阴或膀胱周围间隙，引起结缔组织炎。
大多数的时候跑歩是不能治疗的，可以通过前列腺囊肿，年轻人可以做囊肿的穿刺做引流，一般可以用穿刺针刺入囊肿内，吸出囊肿液，然后注入硬化剂，这种治疗一般三个月后恢复正常。
跑步可以加速前列腺的血液循环，帮助减轻前列腺囊肿的症状。如果前列腺囊肿比较小，并不会对尿道造成压迫，甚至还不会出现什么症状，这样的前列腺囊肿是不需要进行处理的。
前列腺囊肿不影响任何事情，不需要治疗。前列腺囊肿就是前列腺腺管局部增生导致，不会导致任何疾病，如果囊肿越来越大，影响排尿可以做囊肿切开，但极少有囊肿导致排尿困难。所以对前列腺囊肿就是定期观察，不用治疗。
临床上把前列腺囊肿分为先天性的前列腺囊肿跟后天性的前列腺囊肿。一般先天性的前列腺囊肿是难以治疗的，后天性的前列腺囊肿是由于前列腺的腺泡部位发生了病变，最终形成囊肿，此种是可以治疗的。