早期的腹腔镜手术，多采用五孔法，随着设备的改进，技术逐渐成熟，由五孔法改为三孔、两孔、单孔、单孔，对病人的伤害越来越小。目前，TaTME、NOTES手术均能达到不留疤痕的目的，且具有较好的美容效果，得到了越来越多的病人的认同。如果肿瘤很小，没有侵犯周边或有大量的淋巴结转移，可以通过NOTES或TaTME手术来降低疤痕的发生。
最典型的多囊卵巢腹腔镜手术是剖腹进行的，而腹腔镜下多囊卵巢的外科治疗很少见。腹腔镜下的子宫楔形切除，会导致子宫周围的粘连和盆腔的粘连，在临床上很少见。对于促黄体生成素含量高的病人来说，可以起到很好的作用。但也有一些问题，比如治疗无效，导致卵巢功能低下，只有少数符合条件的病人，才可以进行腹腔镜下多囊卵巢的手术。
女性在做了输卵管囊肿剔除手术之后，如果输卵管的功能正常，是可以再次怀孕的。但是有很多女性在手术以后输卵管形成瘢痕组织，导致输卵管蠕动功能有异常，此阶段容易出现宫外孕的现象。
治疗可以通过药物手术还有中医治疗。较早的检查方法就是通液检查。顾名思义就是将管子与宫腔相连，注入药水，如果药水顺利通过输卵管则输卵管没有囊肿堵塞，反之则需要进一步检查了。还有是用输卵管造影检查。通过造影技术可以清晰地看到输卵管内部状态，相比第一种方法简单清晰，且副作用较小。
输卵管囊肿手术三个月以后才可以怀孕，三个月后怀孕前也是需要先做个输卵管造影，检查一下输卵管是否畅通。如果畅通才可以考虑怀孕的，还需要做一个身体的全面检查，排除一下有没有其他疾病。