宫颈囊肿患者通常可以跑步。大多数宫颈囊肿是宫颈生理性的改变，是由于在子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口将腺管口堵塞，导致腺体的分泌物引流受阻，从而形成囊肿。宫颈腺囊肿一般不需要治疗，通常不会对人体造成伤害，一般不会对跑步产生影响，跑步也通常不会导致宫颈囊肿加重。因此，在发现宫颈囊肿后，患者通常是能够跑步的。在跑步的时候，患者要注意做好热身活动，并且要注意控制跑步强度。
跑步不能治疗肝囊肿。但是跑步可以提高病人的身体免疫能力，从而可以抑制肝囊肿的增大，防止病人的肝囊肿出现恶化、癌变的情况。对于肝囊肿的病人是需要根据囊肿的病理来采取药物治疗、手术切除等方式进行治疗。
肾囊肿可以跑步，不受影响，对于囊肿如果较小，可以进行正常的任何运动，如过山车、爬山、跑步以及跳绳、打球都是可以。如果囊肿较大，甚至超过10公分，也是可以进行跑步，但是需要防止腰部受到暴力打击以及防止摔倒，因为腰部受到暴力损伤，会引起囊肿破裂，从而囊内液体渗入到肾周间隙，会导致腰胀、腰痛的症状。
得了卵巢囊肿能跑步不能跑步，是好是及时治疗，卵巢肿瘤会引起下腹或骼窝部充胀、下坠感。严重时会有腹痛腹帐、呼吸困难、食欲降低、恶心及发热等。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。治疗一般是患侧输卵管卵巢切除术。
如果说没有自觉的症状，并且不影响正常的生活活动，只是在查体时发现了有骶管部位的囊肿，这种情况可以进行跑步运动的。因为囊肿比较小，跑步运动时不会导致囊肿反复的摩擦，压迫神经根。
前列腺囊肿通过跑步不可以自愈。囊肿形成的原因有，胚胎期时前列腺腺体发育受阻，中肾导管与中肾旁管发育异常，坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻，使腺泡上皮变厚，引起潴留性囊肿。炎症性囊肿前列腺慢性炎症引起结缔组织增生，导致前列腺导管狭窄、分泌物潴留形成囊肿。寄生虫性囊肿寄生虫引起前列腺管及周围发生慢性炎症；或由肉芽增生，逐渐形成囊肿。具体需要根据原因和囊肿的大小进行治疗。
