一般来说，矮小症需要胰岛素样生长因子、检查生长激素激发实验、垂体核磁共振、性激素、甲状腺功能、微量元素骨龄测定，如果是男孩子建议做睾丸超声检查，如果是女孩子，可以做子宫超声检查、染色体检测等。
家长发现孩子身高明显落后于同年龄，或是同性别的孩子，应该立即带其去医院咨询，如果确诊矮小症，建议尽早治疗。
矮小症的检查项目包括全身的测量，病史询问，实验室相关检查，包括生长因子，甲状腺素，以及其他相关的肿瘤因子，寻找内分泌或肿瘤方面，是否存在造成矮小症的不良因素。拍骨龄片，影像学检查。
可以查查甲状腺功能，垂体磁共振，以及生长激素激发试验等，根据结果针对性治疗，了解是否存在垂体发育缺陷、占位病变等。怀疑有先天畸形等情况的还需做染色体分析，明确诊断后才能选择正确的方案进行治疗。
对于生长激素缺乏，特发性矮小，先天性卵巢发育不良综合症，足月小样儿导致生长发育迟缓，以及具有其他生长激素治疗指征的患者，通过生长激素的治疗。
生长激素治疗具有一定的副作用，不可随意的滥用，所以患者在进行治疗前应进行全面的评估，在治疗过程中应进行密切地监测，严格的控制生长激素的剂量，保证效果。平时可以可以服用钙片，注意饮食，不要吃辛辣油腻的食物，做一个骨垢线方面的检查，如果骨垢线将要闭合，并没有完全闭合的情况下，可以短期使用生长激素，应多吃蔬菜和高蛋白食物，和优质蛋白食物和含有钙丰富的食物。
矮小症住院根据患者的情况和处理方式，医院的住院天数并没有明确的估计。
矮小症住院到儿童内分泌科或者生长发育专业检查，需要进行骨龄、血尿常规、肝肾功能、微量元素、性激素水平、甲状腺功能、乙肝三系、生长激素激发测试、头部核磁共振等检查，确定儿童的发育水平和原因，然后进行相应的检查，并展开针对性的治疗。要注意儿童的营养丰富。
矮小症可通过应用生长素、积极锻炼、进行心理调节等进行治疗。
由于长期腹泻或营养不良所致的矮小症，需通过改变饮食来增强患者身体营养，并通过治疗腹泻来缓解矮小症。生长激素缺乏症患者可采用生长激素针治疗，普通矮小症需要1-2年左右才能达到理想的治疗效果。可根据自身情况选择生长激素注射剂量。孩子出现矮小症后，不仅要补充营养，还要注意锻炼，要加强运动，尤其是弹跳运动，并保证孩子充足的睡眠。同时孩子身材矮小会导致自卑、抑郁等，家长可通过心理辅导，与孩子进行沟通，如培养兴趣爱好，增强自信，逐渐改善孩子抑郁等心理问题。