可以查查甲状腺功能，垂体磁共振，以及生长激素激发试验等，根据结果针对性治疗，了解是否存在垂体发育缺陷、占位病变等。怀疑有先天畸形等情况的还需做染色体分析，明确诊断后才能选择正确的方案进行治疗。
矮小症的检查项目包括全身的测量，病史询问，实验室相关检查，包括生长因子，甲状腺素，以及其他相关的肿瘤因子，寻找内分泌或肿瘤方面，是否存在造成矮小症的不良因素。拍骨龄片，影像学检查。
如疑似患儿患有矮小症，要到医院做进一步检查，以明确原因，通常检查方法有头颅磁共振，骨龄拍片等、生长激素刺激试验等，在临床上很多家长并不了解这种疾病。多数儿童因生长激素不足而发病，这时就需要给宝宝注射生长激素对症治疗。
此外，矮小症的患者应该多进食优质蛋白的食物,比如黄豆、鱼肉、牛肉,另外也要补充维生素类食物。
儿童矮小症需要做的检查如下：
第一步，要做全身检查，首先要做的就是测量孩子的身高、体重，然后和正常的小孩做比较，看看是否达到了标准值。第二，询问患者的病史，比如家长的身高，这也是影响孩子身高的一个重要因素，根据基因的不同，可以考虑到孩子的基因身高。第三，需要做一些相关的化验，比如生长激素、甲状腺功能、肝、肾、血常规等，以找出导致儿童矮小症的原因。第四，通过拍骨龄来确定孩子的骨龄。第五，核磁共振是一项重要的检查，以确定是否存在脑垂体肿瘤。
如疑似患儿患有矮小症，需到医院进一步检查。
矮小症的检查，比如说探测骨龄，看是否超前或滞后，女生的话也要进行子宫及附件彩超。在这个过程中，医生要仔细地观察孩子身体各部位是否正常，尤其是身高上的变化，比如腹部的脂肪多少。也有用抽血化验的，观察儿童血液生长激素含量。在体检时也要注意一些细节问题，比如血常规的测定。同时也要进行甲状腺功能检查，头颅磁共振检查，尤其是有关脑垂体的检测。
