三个月宝宝睡觉老是摇头可能是缺钙、窒息缺氧病史等原因导致的。
1.缺钙：如果家长没有及时给三个月宝宝补充维生素D，可能会影响钙的吸收，容易导致缺钙，可能会引起神经兴奋性增高，导致睡眠不安，从而出现睡觉老是摇头的症状。
2.窒息缺氧病史：如果三个月宝宝出生的时候有窒息缺氧病，可能会影响正常的脑部功能，容易影响睡眠状态，从而出现睡觉老是摇头的症状。
三个月的宝宝睡觉老是摇头一般是缺钙、湿疹、植物神经紊乱等原因导致的。
三个月的宝宝处于成长发育的重要阶段，如果平时进食不当可能会导致三个月宝宝缺钙，造成交感神经兴奋，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。三个月的宝宝身体新陈代谢比较快，可能脖颈部出汗较多，此时可能会导致湿疹，造成瘙痒，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。同时三个月的宝宝神经发育不成熟，可能会出现植物神经紊乱的情况，造成三个月的宝宝睡觉老是摇头。
一般情况下，宝宝三个月睡觉老是摇头可以是以下原因导致的：
宝宝三个月睡觉老是摇头，这就是维生素D和钙质的经典表现。缺乏维生素D和钙质的宝宝三个月会导致神经肌肉的兴奋，主要是由于汗腺的分泌增加，汗珠会刺激到头部，如果觉得痒，就会在枕头上来回的晃头，导致宝宝三个月睡觉老是摇头。还有就是睡眠浅、睡眠不安详，稍有一点声响就会惊醒，也会导致宝宝三个月睡觉老是摇头。
宝宝睡觉老是摇头需要给宝宝补充维生素。宝宝睡眠的时候反复地出现摇头，是维生素d缺乏，会出现出汗比较多，孩子头部瘙痒反复地摇头摩擦头部，长时间地出现这个动作会出现枕秃。需要常规的给予补充，维生素d每天至少200到400单位。
宝宝有摇头的症状建议去医院看儿童保健科。
宝宝摇头可能是平时生活中缺乏维生素D及钙剂导致的，一般年龄段较小的婴幼儿常见，尤其6个月以下的婴儿。宝宝缺乏维生素D会导致神经兴奋性增高，可能出现易惊、哭闹、睡眠不安、多汗等情况。孩子头部出汗会较多，头皮瘙痒，宝宝容易有左右摇头的症状，宝宝的枕部头发会被磨掉，形成枕秃。
小孩子睡觉时摇头是常有的现象，与头部痒有关系，另一种是宝宝的枕头，有寄生虫，常见的是螨虫，引起宝宝不适而引起摇头。也可能是宝宝有些缺钙，要及时给宝宝补钙。小孩子的枕头，可以用茶叶枕，又透气又能防止螨虫的生长。平时日常生活护理中，至少2~3天要给宝宝洗一次头。
