甲状腺功能包括甲状腺素、三碘甲状腺原氨酸、游离甲状腺素、游离三碘甲状腺原氨酸和促甲状腺素。甲状腺相关抗体包括甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体、促甲状腺素受体抗体、甲状腺微粒体抗体，这些指标是判断自身免疫性甲状腺炎以及Graves病的指标。甲状腺球蛋白这项指标一般用于因甲状腺癌做甲状腺全切术后判断是否复发。rT3这项判断甲亢或甲减的辅助指标。
想要进行新生儿先天性甲减的筛查和通常的体检等甲状腺功能的早期筛查，通常只需要调查甲功三项就足够了。理由如下：
1、因为甲功三项大致可以反映甲状腺功能的状况。
2、甲功检查并不便宜，在初筛阶段，不需要做更高的检测。
3、TT3和TT4的测定易受血清中TBG指标的影响。在TBG数据异常的情况下，TT3和TT4的测量结果也容易出现异常，特别是TT4受到更大的影响。
进行的甲状腺功能的检查一般都是甲功三项，主要包括血液中的游离甲状腺激素，结合甲状腺激素的水平以及促甲状腺激素的水平，这些指标可以初步的反应甲状腺功能是否正常。
甲状腺癌术后复查项目主要包括甲状腺功能，其中一定含有促甲状腺激素和甲状腺球蛋白。
特别是甲状腺全切患者，甲状腺球蛋白指标非常重要，他既往病史低、突然升高，需高度考虑甲状腺癌是否复发。甲状腺癌术后复查项目还包括血常规、肝肾功能、电解质及血脂、肿瘤标志物等。甲状腺癌术后复查还包括甲状腺彩色多普勒，即甲状腺超声检查，以检查淋巴结是否肿大或残留。
一般甲状腺功能检查有五个项目。
这五个项目分别是促甲状腺激素检查、游离三碘丙戊酸甲状腺激素检查、游离甲状腺激素检查、总甲状腺激素检查和总三碘丙酸甲状腺激素检查。一般来说，检查四个指标后就能反映患者甲状腺分泌的甲状腺激素水平。同时，检测以上5个指标可以反映人体甲状腺功能是否正常。如果只是想要进行简单的体检，检查前三个即可。但是如果要完善甲状腺相关疾病的筛查，可能还需要检测患者相关的自身抗体。
