输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
治疗输尿管结石需要结合结石的大小来采取相对应的治疗方法，如果输尿管结石小于1cm，并且没有明显的尿路感染，可以大量饮水，服用中药，使结石排出。但如果结石较大，可以使用输尿管镜下取石和碎石，以及体外冲击波碎石，去正规的医院做一下详细的检查，遵循医嘱，采用适合的方法治疗。
输尿管结石是泌尿外科常见病、多发病，根据结石的部位可以分为输尿管上段、中段和下段结石。输尿管下段结石的治疗，如果结石小于0.5cm，可以采用保守治疗，通过多喝水、多活动、多排尿口服排石的药物进行治疗。如果结石大小在0.5-1cm，可以采用体外冲击波碎石，也就是体外碎石，需要注意如果是未婚女性不要采用这种办法。
输尿管结石手术，常见的就是输尿管镜钬激光碎石、输尿管切开取石、腹腔镜切开取石以及经皮肾镜手术碎石取石，这些手术都需要麻醉，手术后都需要留置DJ管在输尿管内支撑，所以这些手术后患者不能有效的排尿，所以必须要留置尿管。
左侧输尿管结石要根据结石的大小可以通过口服排石的药物并且大量喝水结石应该能够排出体外的，如果输尿管结石大于六毫米以上，很难自行排出激光碎石手术治疗才能够把结石粉碎。