针对肾结石，肾囊肿的病人，具体怎么办还是要根据具体结石的病情以及囊肿的病情来决定具体的治疗方法。
要给患者做彩超，CT及其他检查以明确肾结石具体情况和肾囊肿大小及其他病情。在这些方面都要根据患者实际的病情进行具体的分析，这样才能够制定出相应的方案。通常情况下，肾结石如体积较小，梗阻轻者可采用某些药物处理，许多患者都能以保守方式排出结石。如结石的体积较大，也许有必要用手术方法清除肾结石。在临床中通常会选择肾穿刺取石和经皮肾镜取石术这两种方式。肾囊肿通常都属于良性疾病，如体积小患者无症状，然后就能定期观察了，若囊肿超过四厘米，或认为囊肿可能恶变，则应积极手术。
如果有胆囊肿大，胆囊壁增厚，且结石较大，是需要外科手术的。即使你现在没有症状。以后会发生症状的，掉下来还有可能引起胆管梗阻。到正规医院肝胆外科进一步就诊，择期行胆囊结石手术。一般都是微创的，术后恢复快。
肾囊肿是多发性良性肿物，生长缓慢，不用紧张，囊肿很小，注意观察。每年定时复查肾脏彩超观察囊肿大小及肾脏功能指标。肾结石只要不疼痛，一般不需要治疗，平时要多饮水。
一般肾囊肿，肾结石容易出现症状，经常是突然肾绞痛，腰酸胀痛，腹部也会不舒服，结石疼痛发作，可以喝一些药物，多喝水，可以多运动时不发作，发作时可以用止痛的药，也有消炎药，休息时，暂时不活动。
肝内胆管结石和肝囊肿同时发生需要到正规医院接受治疗。如果肝内胆管结石呈淤泥状分布且直径相对较小，有时会随着胆汁代谢排出体外因此可以不用手术治疗。然而，如果结石的直径相对较大，并伴有明显的腹痛，需要手术治疗。因为直径较大时恶性转化的风险会相应增加。
如果胆囊穿孔，是一种非常严重的疾病。由于胆汁在胆囊中，是一种化学物质，如果胆囊破裂，会引起胆汁性腹膜炎、继发性细菌感染、败血症等严重并发症。因此一旦明确需要考虑及时的外科治疗，访问肝胆外科，不能延误治疗时间。
