输尿管结石疼痛是由于结石梗阻导致的，而输尿管结石疼痛的位置是由于结石的位置而决定的，不同的位置就可能造成不同的疼痛部位。输尿管结石梗阻于上段输尿管时，产生的疼痛主要位于后腰部或两侧腹部处，并沿输尿管行径，放射至同侧睾丸或阴唇和大腿内侧。
输尿管结石主要是由于输尿管的管径略小于结石的直径，因此会在结石排出的过程当中形成局部摩擦以及卡压，由于输尿管黏膜上有很丰富的神经就会感知到疼痛，同时结石在排出的过程当中也会刺激输尿管黏膜，而导致输尿管强烈的收缩，因此就会出现比较明显的疼痛症状。
输尿管结石手术，常见的就是输尿管镜钬激光碎石、输尿管切开取石、腹腔镜切开取石以及经皮肾镜手术碎石取石，这些手术都需要麻醉，手术后都需要留置DJ管在输尿管内支撑，所以这些手术后患者不能有效的排尿，所以必须要留置尿管。
输尿管结石其典型表现，一般就会表现为疼痛，比如突发的剧烈的腰痛和腹痛。那是因为是结石的影响，当结石从肾掉入到输尿管里的时候，会刺激输尿管，造成输尿管的一个痉挛，所以表现出疼痛，一般是阵发性的这种绞痛，类似一种肠痉挛那种疼痛。还有另外一个因素就是，当结石进入到输尿管里的时候，会造成尿液排泄的一个阻塞。
输尿管结石对性功能是没有什么影响的。如果有输尿管结石，也会导致肾充血和肾萎缩，导致性功能不良。术后需要多喝水、多排尿、多跳跃利于结石的排出，并定期复查了解。
输尿管结石因为嵌顿位置不同，导致的疼痛部位也不同，如果在输尿管上段，可能是腰部疼痛，如果在输尿管下段，一般是靠近下腹，但是当排尿的过程中，如果膀胱结石进入尿道，造成尿道堵塞，会引起阴茎疼痛明显。