临床上常见的抗菌药物有，大环内酯类、氟喹诺酮类、多西环素、米诺环素等，这些药物都能杀死支原体。使用上述药物进行治疗的周期一般为10~14天，一些顽固性疾病的病人可以持续3个星期。18周岁以上的人要尽量不要服用喹诺酮，应在医生的指导下使用适宜的药物进行治疗。
大环内酯类药物、氟喹诺酮类药物等可用于杀死衣原体和支原体。
1.大环内酯类药物：支原体感染会导致肺炎、支气管炎、泌尿生殖系统感染等，可以口服阿奇霉素、红霉素、罗红霉素等，阿奇霉素的治疗效果最好。阿奇霉素具有抗菌、消炎、上呼吸道感染的作用，是治疗支原体感染的首选药物。
2.氟喹诺酮类药物：可以口服氧氟沙星、左氧氟沙星等，也有一些人会出现头痛、失眠、局部红疹等不良反应。
患者需要遵医嘱用药，不可擅自用药。
通常情况下，衣原体和支原体的病原体可以被杀死。具体方法如下：
1、支原体、衣原体病原对温度较敏感，可以通过消毒、加热等方法将其杀死。
2、患者一定要遵医嘱服用足够数量的用药，以及足够的疗程。因为药物对杀死衣原体和支原体的病原体也有一定的作用。
通常情况下，需要给予罗红霉素、阿奇霉素、四环素等大环内酯类的药物，在1-2个星期后即可完全清除。
如果是轻微的炎症，可以服用罗红霉素，服用3-5天。如果是中、重型的，通常要7~10天，严重的患者通常要在医师的指导下进行药物注射，不能依赖药物。
阿奇霉素大多约1周~2周就能杀灭支原体。
阿奇霉素是大环内酯类消炎药，对支原体感染、衣原体感染的作用，疗程多为10~14天左右。若临床症状相对较轻微，大约一星期内恢复正常，如临床症状较严重，很可能要两个星期，甚至更久。该药对革兰氏阴性菌和阳性菌均有效，尤其是耐药率低，安全性高，治疗期间还应根据病人临床症状配合使用。
前列腺细菌杀死了症状没消失，还需要治疗。前列腺液中仍有较多的白细胞，仍需规律治疗一段时间。前列腺有细菌服药时间较长，至少一月以上。细菌性前列腺炎，治疗后需要及时复查。
