甲状腺组织的病理改变不均匀，光镜下滤泡失去完整性。在正常的甲状腺素水平基础上，有相当一部分病人出现高滤泡性结节。
血管内皮细胞增生并有不同程度变性坏死，毛细血管壁增厚呈瘢痕样变化。典型的病变是包绕多核巨细胞，滤泡损害，其中心是胶质，进一步发展为肉芽肿。周围组织可见大量中性白细胞浸润。间质有炎性反应。纤维增生和血管生成等病理改变。久而久之，表现为不同程度纤维化和滤泡区域再生。
亚急性甲状腺炎症通常可以自愈。
亚甲炎是由于病毒感染所致的甲状腺炎症，临床上没有特别的治疗措施。远期预后良好，复发率极低，每年约2%的复发率。此外，亚急性甲状腺炎是一种自限性疾病，多数患者通常是可以自行痊愈的，但是在某些地方出现的肿胀和不适症状会持续几个月或更久。在康复过程中，需要对病人进行心理治疗，还要保证病人的情绪稳定，并建立起战胜疾病的信心。
亚急性甲状腺炎多导致内分泌系统变化，因此，治疗上以内分泌科居多，但有发烧或全身乏力症状，以及其他某些外科，亦可到普通外科就诊。
亚急性甲状腺炎是一种病毒感染性甲状腺炎症性病变，主要表现为甲状腺疼痛，可伴有发热、乏力、肌肉酸痛等，如果发现了有明显甲状腺肿大或者结节，就需要及时就医检查，以免延误病情而造成更严重的后果。对亚急性甲状腺炎病人来说，平常饮食要颇为讲究，勿食辛辣刺激性食物，也勿饮浓茶。
亚急性甲状腺炎血沉增高可能是患者患有亚急性甲状腺炎或是由病毒引起，具体分析如下。
亚急性甲状腺炎又称巨细胞性甲状腺炎，柯萨奇病毒和腺病毒是导致亚甲状腺炎的主要原因。典型的症状是甲状腺肿大、疼痛等，严重时会出现发热、头疼、乏力、口干等全身症状。主要表现为上呼吸道感染，病毒感染后1-3周。血沉快是甲状腺激素的特点，一般血沉在每小时50毫米以上。
亚急性甲状腺炎可能会影响怀孕。
亚急性甲状腺炎很可能影响妊娠，因此，想怀孕必须等亚急性甲状腺炎治好了。在妊娠期当中，对于一些没有症状或者是轻度的亚临床甲状腺炎患者，一般都不会对其身体造成明显的影响，因为病情相对较轻。还有少部分亚急性甲状腺炎，不能根治，就很可能留下永久性甲减，但若留下甲减，仅需补充甲状腺激素即可，使病人甲状腺功能在妊娠规定范围内，即可妊娠。
亚急性甲状腺炎可以怀孕，但是在急性期最好不要怀孕，因为亚急性甲状腺炎是由病毒感染引起的。不是感染了病毒的最好时机。亚急性甲状腺炎分为甲亢期、甲减期和恢复期，在甲状腺功能恢复后，身体状况良好的时候进行妊娠，对孕妇和胎儿都是有益的。也有少数的亚急性甲状腺炎，不能够被治愈，此时有可能会遗留永久的甲减，但是如果遗留甲减的时候，只需要补充甲状腺激素。