囊肿增大的时候，可以出现脑局部的组织受压所表现出来的一些功能缺失，比如乏力、感觉障碍，囊肿比较大已经形成压迫症状，或者是一个颅内高压表现或者出现癫痫的状态，进行囊肿的手术干预，比如囊肿的造瘘术或者囊肿的低压分流手术。
新生儿脑部囊肿如果比较小，是不需要采取治疗的。家长千万不要没事就用手挤捏按压，否则会容易刺激囊肿增长过快，还容易引起炎症感染。如果囊肿增长比较快，就应该带孩子到医院就诊检查，选择合适的时机采取手术治疗。
脑部蛛网膜囊肿是由于脑部感染所引起的，要做脑积液检查和脑部CT检查，明确确诊，应当及早服用抗生素进行治疗。平时出现细菌病毒感染时要及早治疗，以防止细菌病毒通过血液进入大脑形成囊肿。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
卵巢囊肿分很多种，如果是生理性的，属于正常现象，不需要做特殊的处理，但如果是病理性的，就需要做手术。生理性的囊肿，包括卵泡、黄体，小于5cm，以囊性为主。但如果是病理性的囊肿，指直径大于5cm，或者持续存在三个月左右。
