治疗卵巢囊肿的中药主要是活血化瘀类的，常见的有当归、茯苓、益母草、桂枝、川穹等等，这些中药可能具有抑制卵巢囊肿生长的效果，甚至可使其缩小，常用的中成药有桂枝茯苓丸。需要注意的是，不同患者对中药治疗的反应不同，如果服用中药超过2个月，卵巢囊肿依然没有变小，可能需要进行手术治疗。但具体的治疗方案，需要去医院就诊后再确定。
一般情况下，消除卵巢囊肿的药以下几种：
卵巢囊肿分为炎症性卵巢囊肿、生理性卵巢囊肿、巧克力囊肿、卵巢肿瘤等。如果是由于炎症引起的囊肿，可以口服左克胶囊、甲硝唑等抗炎药物进行治疗。黄体囊肿属于生理性的囊肿，通常在经期结束之后就会自行消退。可以口服散结止痛胶囊、桂枝茯苓胶囊等药物进行治疗。如果确诊为卵巢肿瘤，药物治疗一般效果比较差，可以通过手术来进行治疗。
一般来说附睾囊肿没有特效药。
附睾长有囊肿时，对患者没有造成影响，不伴有其它临床症状，可以不用处理，定期门诊彩超复查，观察囊肿的增长趋势。如果短时间内增长的比较快，甚至对附睾造成压迫，导致患者出现坠胀疼痛感，就需要通过手术切除。附睾囊肿并没有好的特效药治疗，通过药物没有作用，手术才是唯一的治疗方法，而且要做病理化验，排除一下恶性的可能。
卵巢囊肿是一种新生肿物，除了正常的卵巢结构外，大部分都是囊性的，统称为卵巢囊肿。
卵巢囊肿的病因可分为生理和病理两种。按照肿瘤的性质，可以分为良性的、交界性的、恶性的。卵巢囊肿是由遗传因素造成的，有20-25%的资料报告，精神压力和不良的生活习惯等。
另外，由于卵巢自身某些成分的变异，也会引起卵巢囊肿。无临床症状，通常是在日常检查中偶然发现的。因此，在临床上，只要没有特别的症状，没有特别的不适，是不需要特别治疗的。
多数时候，腱鞘囊肿并没有明显症状和明显伤害，要注意休息并持续观察即可。
但腱鞘囊肿若是渐渐变大，很可能造成局部疼痛之征象，若被某些神经血管所围绕，则可使这些神经血管受压而产生缺血和神经损害之征象。如果腱鞘囊肿出现疼痛、活动受限等不适症状，建议就医采取抗炎止痛药物治疗，如果病症严重，建议在医生指导下采取手术治疗，控制病情。
