一般来说，停经40天b超看不到孕囊的主要原因是以下这些：
1、月经不正常、受孕晚，有的女人月经不规律，一般要40多天才来一次，这个时候，即使检测出来了，受孕的时间也比较晚，在子宫里见到孕囊的时间也比较晚。
2、可能是因为子宫外孕，也可能是因为妇科的炎症，比如输卵管炎。B超检查没有发现孕囊，有阴道出血、腹痛等症状患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
通常情况下，停经40天看不到可能是检测过早。宫外孕导致的。具体情况分析如下：
在怀孕早期，孕囊可能还没有发育，但也有可能是因为宫外孕早期，并没有发现孕囊。建议女性在一周后到妇产科做盆腔超声，确定孕囊的发育，同时还可以去医院做HCG和血孕酮检查，看看有没有孕激素不足，如果孕激素下降，可以在医生的指导下口服黄体酮类的药物来改善。
若月经规则，但停经39天未见孕囊需警惕是否胚胎发育不良、胚胎停止发育。需动态观察血hcg和B超结果明确诊断。若平时月经不规则，周期延长，推迟7天或以上，则停经时间和实际受孕时间不相符，停经40天但实际受孕时间不足40天，有可能做B超未见孕囊。可隔段时间再次复查B超了解胚胎发育情况。
停经45天B超没有发现孕囊一般有三种可能。一种可能是其实没有怀孕。如果患者怀疑自己怀孕了，可以做人绒毛膜促性腺激素的测定。第二种可能是怀孕的时间比较短。正常情况下怀孕35天能在B超上见到孕囊。如果怀孕的时间比较短，在停经45天时B超没有见到孕囊是正常的。第三种可能是宫外孕。一般是孕囊种植在子宫体腔以外，不容易被发现。如果是在通过抽血检查确定怀孕的情况下，可以一周以后再次复查超声。。
一般情况下，停经69天才长出孕囊肯恩是正常现象，还可能是排卵期延迟，具体内容如下：
停经那么久，怀孕的时候会有孕囊的发育，可能是因为体内的荷尔蒙分泌不够，导致孕囊的形成迟一些，不过也有可能会延迟排卵期，或者怀孕的时候会更迟，如果孕囊发育的很好，那就是一种很常见的生理问题。怀孕期间应在妇科医师的指导下进行怀孕期间的常规体检，平时要注意饮食，多休息、多锻炼。
一般情况下，停经69天长出妊娠囊的原因分为2种：
1.病人月经不规则，通常月经周期持续时间较长，为2-3月，而且排卵期也比较推迟，受精比较迟，因此才会出现妊娠囊刚刚长出来。
2.妊娠已达69天，但病人还没有到医院就诊，最近才发现妊娠囊，在此情况下如月经规律者，可能会出现胎停育，建议复查彩超，观察妊娠囊有无增大、有无心血管搏动。如果没有胎停就可以继续妊娠。