双肾结石可以通过喝水、药物、手术等方式进行治疗。
对于结石较小，且没有尿道阻塞或感染的患者，保守治疗是首选的。如果是6mm以下的结石，可以通过多饮水来调节饮食。病因治疗：病因明确的肾结石要从根本上解决，比如：甲状腺功能亢进要把肿瘤切除，阻塞要清除梗阻，炎症性结石要彻底清除感染，要对症进行镇痛解痉、利尿排石，同时还要注意防止感染。体外震波疗法是指通过碣石附近的冲击波引起的一系列物理作用，对直径小于1cm的结石进行治疗。如果不能用药物来减轻疼痛，或结石的直径很大，可以通过外科手术来取出结石，或将其粉碎为细小的颗粒。
最重要的看患者的肾功能，如果肾功能还好，可以通过碎石，进行钬激光碎石，还有一些超声碎石经皮肾经的取石来做治疗，目前大家都知道可以微创技术，所以经皮肾的微创技术取石，现在是一种比较常见的手术方式。
尿道结石的治疗首先是保守治疗，适用于直径小于0点5cm且表面光滑的结石，其次是手术治疗，适用于引起尿路充血、水肿甚至梗阻的结石。尿道结石的治疗方法需要依据结石的位置选择适当的方法。首先是结石为尿道前端的舟状窝和结石在前尿道，可以无菌液体，再轻轻地向尿道远端推挤，把结石推出尿道口外或者用血管钳夹出来。再次是后尿道结石，可用金属尿道探子，将结石轻轻地推入膀胱，在膀胱结石来处理。
肝内胆管结石的临床治疗方法多种多样，如肝内结石较小，无症状时，可先行临床观察，如靠肝门较近，可行手术取石，但肝内胆管取石后易复发，因此肝内胆管结石可进行手术切除治疗，如左侧肝内胆管结石，可将左侧部分肝组织、胆管、结石切除，右肝若完好则可保留，严重时需行肝移植手术进行治疗。
平时应该注意漱口，尤其是饭前、饭后，在咽腔壁多使用漱口水漱口，有一些小结石可以清理出来。如果结石比较顽固，也可以考虑用筷子或者小汤匙，将扁桃体结石剜出。如果反复出现炎症刺激，还可以去耳鼻喉科进行局部麻醉，将扁桃体周边结石一起切除。
前列腺增生伴结石的治疗方法很多可以通过药物治疗，或者中医调理，严重的是需要做手术治疗的，具体治疗方式也是病情严重程度来定，自己不用担心，针对性的治疗是可以，在治疗期间也是要注意饮食清淡。
