根据病情选择支气管镜下取石，或者是手术切除的方法。对于不伴有肺实质损伤的，可以首选支气管镜下取石，微创的并发症较小。对于反复出现肺部感染，以及反复大量咯血以及肺脓肿的，可以选择手术切除的方法。
结石疼的时候可以肛门内给药，最常见的就是双氯灭痛栓50mg纳肛，一般3-5分钟就可以缓解疼痛。也可以肌肉注射止疼药物，比如强痛定、杜冷丁、654-2、黄体酮等，也可以静脉滴注间苯三酚、654-2。
牙结石可以用电动牙刷，洗牙，龈下刮治的方式去除。牙结石是由于牙齿表面出现黄色的钙盐堆积物黏附后形成，从而产生牙齿发黄、牙龈感染，产生口臭等症状。平时饮食尽量多吃粗纤维食物，粗纤维的食物能对牙齿表面起到摩擦的作用。
通常情况下，怀孕有肾结石的患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：肾结石是晶体物质在肾脏异常聚集所致，可能会出现腰腹部疼痛、血尿、恶心、呕吐等症状，怀孕有肾结石的患者可以按照医嘱使用排石颗粒、肾石通颗粒、尿石通丸等药物进行治疗。
手术治疗：患者生产后再给予患者行经尿道输尿管结石取石碎石术。
肾结石腰酸，建议患者及时去医院做详细检查，以清楚腰酸的成因。
肾结石若形成较严重梗阻而造成较严重肾积水时，则可因结石肾积水而腰酸背痛。在治疗上则应积极采取手术方式来解除结石所造成之梗阻，排出结石，患者之此种腰酸便可能渐渐减轻。如果患者肾结石并不会造成严重梗阻、严重肾积水的话，通常腰酸很可能是因为还有其他原因，例如腰肌劳损、腰椎间盘突出等。
