生殖器疱疹的症状主要是水疱和溃疡，水疱是生殖器疱疹的早期表现，当初发或者复发的时候首先表现为局部的红斑，红斑的基础上出现一些比较亮晶晶的、比较壁薄的、容易破损的水疱，多个堆在一起，相互之间的距离不会太远，而且水疱的大小差不多，一般也就一两个毫米，过几天水疱会破损，破损以后局部会形成表浅的溃疡，溃疡需要等几天的时间才能逐渐愈合，愈合后完全不留痕迹。
生殖器疱疹的临床表现是，含有流动性液体的大水疱，破裂后会产生疼痛的溃疡，溃疡之后结痂。过程可能会持续好几天。也有的表现为皮肤上有一些小疹子和类似丘疹的小肿块。还有些人有一些其他的症状像小便涩痛。
生殖器疱疹在发病初期患部有烧灼疼痛感，出现水疱和溃疡，生殖器疱疹久治不愈对人的免疫系统有一定的损害，也会给心理带来影响，但是是可以治疗的，治疗生殖疱疹用中医中药科学地进行抗病毒，抗免疫的治疗才能使得治疗不复发。
男性生殖器疱疹的病人所表现出来的症状比女性生殖器疱疹的病人明显。多数是在感染病菌后两天到十天以内，就会出现难以忍受的不舒服的症状。男性生殖器疱疹的症状多数发生在龟头、尿道口、冠状沟、阴茎、阴囊等部位，先有灼热感，然后产生群丘疹，有些是一簇，有些是多簇，然后慢慢的形成水疱。时候如果不及时地治疗，几天之后就会转变成脓疱，破了后形成糜烂患者溃疡。感觉疼痛，两到三周后结痂。
生殖器疱疹是单纯疱疹病毒引起的疾病，传播性强。生殖器疱疹主要表现为生殖器出现水疱样疱疹，并伴有瘙痒、疼痛等症状，如继发感染可以出现破溃、糜烂等现象。