甲状腺球蛋白偏低见于甲状腺发育不全、先天性甲状腺缺损、甲状腺损伤。甲状腺球蛋白是甲状腺滤泡上皮细胞分泌的大分子糖蛋白，大部分由甲状腺细胞合成，释放到甲状腺滤泡的残腔。
甲状腺刺激性激素、甲状腺体内碘缺乏和甲状腺刺激性免疫球蛋白，可刺激其产生。甲状腺球蛋白浓度主要由三个因素决定，现有甲状腺分化组织大小、甲状腺损伤程度如外伤、炎症、激素影响主要为TSH、绒毛膜促性腺激素、TSH受体抗体。
甲状腺球蛋白抗体升高，提示自身免疫性甲状腺疾病，提示甲状腺组织处于免疫性炎症活跃状态。抗体显著升高主要见于慢性淋巴细胞性甲状腺炎，中度升高常见于毒性弥漫性甲状腺肿，即Graves病患者。
甲状腺球蛋白抗体主要由甲状腺细胞受损、细胞内甲状腺球蛋白溢出血液、刺激机体而产生。甲状腺球蛋白抗体与甲状腺过氧化物酶抗体临床意义相同，均为自身免疫性甲状腺炎的标志性抗体。甲状腺球蛋白抗体也可用于治疗Graves病的疗效观察，以及甲减的预后判断。
甲状腺球蛋白抗体水平高表明患者有自身免疫性甲状腺炎。
自身免疫甲状腺炎包括桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、产后甲状腺炎、无痛性甲状腺炎等。这种类型的甲状腺炎发生后，患者的甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体水平往往会升高，患病后，部分患者甲状腺功能减退，终生需要补充甲状腺激素等药物进行治疗。比如绝大多数的产后甲状腺炎及无痛性甲状腺炎的患者有可能治愈，而桥本甲状腺炎及萎缩性甲状腺炎的患者，不能够完全被治愈属于终身疾病。患病之后部分患者会出现甲状腺功能减退，需要终身补充甲状腺激素此类药物进行治疗。
大分子糖蛋白是由甲状腺滤泡上皮细胞产生的。
甲状腺是否有异常病变可以用来做甲状腺球蛋白的检查。比如：甲状腺缺损，甲状腺功能不完善等。在分化性甲状腺癌中，甲状腺球蛋白是一种重要的肿瘤标记。因此可以用来评价甲状腺癌的临床疗效。如果这一数值不正常的上升，可能是因为有毒副作用的甲状腺肿大，亚急性甲状腺炎，以及其他一些慢性的甲状腺炎。
这类抗体高说明甲状腺存在自身免疫相关性疾病，比如桥本氏甲状腺炎，也称自身免疫性甲状腺炎。如果单纯这项抗体阳性，而甲状腺素三项正常，就可以不用处理。如果抗体阳性伴有这三项异常，提示甲状腺存在功能异常，可以给予药物治疗。
甲状腺球蛋白低可以通过以下方式进行治疗：
甲状腺球蛋白低，会导致甲状腺功能减退，患者在平时应要注意加强营养，多吃高蛋白质的食物，如牛奶、牛肉、鸡蛋等，平时要多食用富含维生素的蔬果，避免抽烟喝酒。在日常生活中还要注意多休息，平时要多做一些锻炼。必要时可以在医生的指导下使用左甲状腺素钠片、甲状腺片、阿法骨化醇软胶囊等药物进行治疗。