垂体囊肿可以通过手术去除，可以开颅手术采用额下外侧入路，另外一个是经鼻蝶手术，也就是通过鼻内镜手术。前者的手术创伤大，后者的创伤小一些。当然，囊肿是良性的病变，如果现在囊肿很小，没有影响垂体功能，是没有必要做手术的，这不会有什么特别的影响。只有囊肿非常巨大，对于垂体和视神经造成压迫出现明显症状的，才有必要做手术处理。
囊肿虽然有可能并没有本身太大的伤害，但是要注意一点，就是因为发生在脑垂体部分比较重要，那么第一个有可能，会产生局部的压迫作用，囊肿本身有可能会压迫导致局部组织出现破坏，另外有可能影响内分泌。如果激素比较异常，必须口服药物来治疗，如果严重可以做手术。
脑垂体囊肿长到一定程度时，会压迫邻近的脑神经、垂体、视神经引起一种或多种症状，头痛、内分泌紊乱、导致小儿发育迟缓、女性还可能出现月经不调，甚至是闭经，不孕。面容及肢体上的改变。视力障碍。
脑下垂体蝶鞍部囊肿大多数是先天性发育异常造成的，会压迫脑垂体引起神经压迫症状，是有危险性的。病人应该及时到正规的医院进行检查，要注意休息，多吃新鲜的蔬菜和水果，尽量不要吃辛辣刺激的食物。
肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。
