肝门胆管癌恶性程度较高，但如果早期得到及时的手术及后续的综合治疗，存活在5年以上可能性较大。但很多肝门胆管癌发现时病程偏晚伴有远处转移，或病人肝功能不能耐受手术，只能行介入治疗减轻症状，一般寿命明显缩短，平均在半年。肝门胆管癌发现为晚期病人，不能接受任何治疗或放弃一些综合治疗，寿命一般只能维持2个月。
大部分的胆管癌晚期有可能活3月-6个月左右，胆管癌后期可以3个月到6个月，胆管癌本身就是恶性程度非常高的消化道肿瘤，5年生存率不超过30%。如果出现胆道出血造成失血性休克，可造成数小时或数日内死亡。
生存期比较短，在3-5年，一般恶性程度比较高，可以考虑吃中药抗癌治疗比较好，可能难以介入治疗，可以中药抗肿瘤，增强患者抵抗力，有助于延长生存期，注意平时少吃多餐，加强营养，吃点鸡蛋，牛奶，有助于提高患者生活质量。
晚期胆管癌，可能生存期比较短，恶性程度比较高，可以考虑吃中药抗癌治疗比较好，可能难以介入治疗，可以中药抗肿瘤，增强病友抵抗力，有助于延长生存期，注意平时少吃多餐，加强营养，吃点鸡蛋，牛奶，有助于提高病友生活质量。
根据病人情况而定，胆管癌若出现肚子胀发烧等情况，是这种疾病的一种正常表现，不要惊慌，可以找专业人士适当的开一些药来控制病情，病人有这种症状一定要及时就医，积极治疗，否则会影响病人的寿命。
胆管癌的预后是极差的及时手术切除，平均生存期也就在13个月左右，很少存活5年以上的，而且病患还已经是胆管癌晚期，所以只能采取放疗化疗以及靶向药物治疗来控制病情的发展，延长病患的生存期，同时配合中药治疗，改善病患体质。