心脏封闭术有一个缺点，那就是在手术中可能发生的各种问题和各种并发症。
一般来说，心脏封闭术对患者的伤害不大。如果是在做外科的时候，发生小的动脉破裂并不会对患者产生什么不良的后果，甚至还会导致动静脉瘘。在进行心脏封闭手术的时候，需要注射一些血管造影剂。手术后出现的感染、炎症等都可以用药物进行处理，不会造成严重的后果。
心脏封堵手术的利是效封堵房间隔缺损，弊是引起心脏及相应组织损伤。
心脏封堵术是一种先天性心脏病，其优点在于可以封住房间隔缺损，室间隔缺损，动脉导管未闭等，防止左心室之间的血流再通，提高心功能，降低心腔扩张的可能性，从而延缓慢性心衰的发展。如有以上症状，应及早行外科手术。但是，同时进行心脏封堵术，也是一项有创伤性的手术，其弊端就是会对心脏和相关的组织造成损害。比如，封堵器脱落，或者是手术中的心包堵塞，会对正常的组织、神经造成伤害，甚至是其他的并发症。
心脏封堵术的坏处有心腔内操作损伤心房壁等，可引起心包出血而导致的急性心包填塞。股动、静脉穿刺部位可引起血肿。如病人有高血压、脑血管病变，还可引起脑出血等并发症。
先心病介入封堵术的注意事项应考虑以下几点：
1.注意观察缺损类型、大小、形态，判断缺损有无缺损或膜部缺损的情况。
2.注意与下腔静脉的联系。
3.对肺部血管压力的测定，如果患者发现的比较迟，比如肺部高压，患者的身体结构就会处于良好的压力下，如果再次进行栓塞，会导致肺部血管紧张，甚至有可能会威胁到患者的性命。
一般情况下，正常心房和心室之间存在着一定的间隙，在成长和发展的时候应该逐步关闭，在关闭的时候，会出现不同的情况，造成心室和心室之间的间隙，从而影响正常的心室。在治疗中，采用一种类似于伞的方法，将周围的动脉扩张至心室，将其堵塞，使其与正常病人的血液循环相适应，以提高病人的临床表现和预后，这就是先天性心脏病介入封堵术，对于先天性房间隔缺损、卵圆孔未闭、室间隔缺损及未闭等患者，进行先天性心脏病介入封堵术有较好的治疗效果。
介入封堵手术会有后遗症，介入手术常见的后遗症，穿刺部位的软组织感染，尤其是手术时间比较长，导丝或者穿刺针反复的刺激也会导致局部软组织的损伤。穿刺部位血管的损伤继发了血栓形成，病人会表现为局部的肿胀和疼痛，严重的还会导致下肢麻木和发凉。血管破裂导致的皮下组织血肿的形成。介入治疗过程当中，导致实质性脏器的损伤。
