新生儿甲减主要是由于先天性的孕期发育的缺陷，导致甲状腺功能低下，甲状腺激素的合成和分泌不足引起的。新生儿甲减的治疗方法:限制对脂肪的摄入，补充一些碘，也可以服用一些药物进行治疗。
甲减的治疗分为轻型病例和严重病例的治疗，早期发现的症状比较轻的情况，主要补充甲状腺素，定期复查甲状腺功能，调整药物剂量，严重病例的甲减，还需要对症治疗，如吸氧、抗感染、改善甲状腺功能减退性心脏病的症状。
想要治疗就应该选择用一些降低甲状腺功能的药物一般主要就是降低促甲状腺激素分泌的水平就可以，而且这一类的病人有些人会出现一些乏力嗜睡的状态，可以选择用一些调节精神状态的药物。
甲减的病人应注意对症口服碘剂进行调理治疗。可以对症口服甲状腺片进行调理治疗疾病。患有碘缺乏的患者临床上多见于地方病所引起的症状。可能会引起大粗脖等临床表现。在日常饮食上应该注意多吃一些含碘较高的食物，应吃一些加碘的食盐，吃一些海带、海菜、紫菜、鱼、虾、蟹等海产品。
妊娠甲减可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善。
亚临床甲减和临床期甲减是妊娠甲减的两种类型。治疗的重点是尽早发现并给予药物治疗，避免对胎儿的发育有不良的影响。3个月以内的促甲状腺激素要控制在2.5以下，3个月之后，促甲状腺激素要控制在3以下。服药期间要定期对甲状腺功能进行检查，调节药物的用量，以达到预期的效果，并对胎儿的发育情况进行动态监测。
