肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
胆管结石容易导致急性发作，容易出现寒战高热、恶心等，可以先采用些消炎、解痉止痛的药物治疗，如果结石比较大，可以进行手术治疗，结石比较小，没有明显的梗阻症状，也可以暂时先观察。
主要看结石的大小决定。如果胆管结石比较小，是可以用保守治疗的方式，不要手术服用药物排石即可，治疗期间卧床休息、禁饮酒或低脂饮食、输液、纠正水电解质紊乱和酸碱平衡失调。若胆管结石比较大，则需要采取胆总管切开取石、胆肠吻合术等手术治疗。
胆道结石术后常规放置腹腔引流管，主要是用于观察腹腔手术范围内的渗血情况和有无胆瘘。一般在术后的3-5天内引流液相对清亮，大约在10ml左右，即可拔除。术后前几天腹腔引流量相对较大，引流液多为术中渗血，随着时间延长，渗血逐渐减少。
肝胆管结石引起胰腺炎可以通过保守治疗、手术治疗等方式进行治疗。
通常肝胆管结石引起胰腺炎患者需要禁食，根据病情决定胃肠减压，静脉补液，抗炎，抑酸抑酶等对症治疗。如果患者疼痛剧烈，可以遵医嘱使用塞来昔布、双氯芬酸钠片等药物缓解症状。必要时治疗需要及时进行手术治疗，期间患者应该规律作息，避免熬夜，以温软的流质饮食为主。
