一般情况下，儿童自闭症的原因，90%是基因导致的，10%是环境的原因。具体分析如下：
儿童自闭症与孕妇的妊娠年龄35周岁以上、出生时的阿氏评分、出生体重低、出生时有窒息、等因素有关。其次是缺少一种心理学的知识，即能够观察到自己和别人的心态（需求，信仰，愿望，意图，情绪，知识，感知），通常孩子4岁就会有心理学的知识，而自闭症儿童则有很大的缺陷。
一般情况下，小孩自闭症指的是小儿自闭症，其原因尚不清楚。可能与基因、神经系统等有关，具体分析如下：
1、基因：常染色体显著性基因也是导致其发生的原因之一。此外，一些自闭症儿童还出现了一些染色体不正常的情况，其主要特征是：染色体断裂。
2、神经系统：，一些儿童自闭症患者的大脑和大脑的生理和心理都发生了变化；
3、孩子妈妈怀孕时有可能受到某些疾病的影响。
目前，自闭症被认为是一种由各种生理原因造成的普遍的发展失调所造成的一种不正常的表现。
自闭症也叫孤独症，是一种异质性疾病，目前还不清楚病因，有可能是由多种生物学原因导致的广泛性发育障碍导致的异常行为综合征。孤独症的发生与基因有关，基因在孤独症发病中起着举足轻重的作用，对孤独症高发家系的研究表明，孤独症与常染色体隐性基因存在一定关系。
还有一些儿童的染色体不正常的研究，神经生物学方面的原因，儿童大脑中的神经传递物质和脑电图的异常。儿童孤独症的发病与孕妇孕期感染有关。
儿童孤独症，一般在3岁以前就会表现出来，其主要表现症状是不同程度的人际交往障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板等，其中约有四分之三的患儿伴有明显的精神发育迟滞，部分患儿在一般性智力落后的背景下具有某方面较好的能力。
孤独症通常发生在儿童中，其诱发要素与通常遗传、分娩期、免疫、环境等要素有关，特别是与环境要素的影响以及儿童童年的成长经验有关。孩子引起自闭症，是因为小时候的不幸经验，或者受到了这种类型的伤害。教育和训练是治疗自闭症的方法，问题很严重，但是可以改善。
