复杂性肛瘘复发的原因考虑是支管清创不彻底等导致的，肛瘘一般是由三部分组成的，也就是内口、窦道、外口，组成简单的肛瘘，如果外口封闭，形成脓肿，积聚到一定程度就会从肛门其它地方破溃而出，这时候就相当于有一个内口，两个或两个以上的外口，这时候就称为复杂性的肛瘘。
肛瘘一般指瘘管分支数量多或外部开口复杂，在一个内部开口中有多个分支，甚至延伸到盆腔内形成复杂肛瘘的肛瘘。一旦发现，都需要尽快手术切除，因为随着时间的推移，它会导致越来越多的瘘管甚至严重的局部感染。
到大医院检查并治疗，肛瘘是不会影响生育的，但是一定得积极治疗。建议可以去肛肠的医院进行手术治疗。平时注意做好预防，以免复发。饮食清淡，多喝水，多吃蔬菜，禁辛辣食物，适当运动。
如果是复杂性肛瘘，治疗方法最根本的治疗方法是手术治疗。但是复杂性肛瘘治疗后会出现复发的几率，在进行完复杂性肛瘘的手术治疗以后，一定要定期的到医院进行复查。平时别吃辣椒，多吃蔬菜水果，注意肛周卫生，保持大便通畅，适当运动锻炼身体增强体质免疫力。
高位复杂性肛瘘一般属于比较棘手的疾病，往往需要挂线手术疗法，但是有的是很难探及完整的瘘管盲端的，特别是高位、近端的那个出口一般高位复杂性肛瘘主要是不能完全切除，因为有损伤肛门括约肌造成大便失禁的可能。挂线疗法往往需要2-3周左右才能愈合得比较好一些。
高位复杂性肛瘘是肛瘘里最复杂的一种，这种肛瘘内口的位置比较高，瘘道的走形比较弯曲，经常会伴发两个或者两个以上的内口，还有的会形成马蹄状的肛瘘，所以是比较复杂的一种疾病，需要手术治疗。
