肛瘘分低位瘘和高位瘘，简单瘘和复杂性瘘，完全性和不完全性肛瘘。具体治疗的方法比较多需要做肛门镜检查确诊。低位单纯性的肛瘘，术后3-4周基本上就恢复了，术后要避免辛辣刺激饮食，避免饮酒，否则容易引起肛瘘复发。
轻微肛瘘症状，流脓，肛瘘流脓的程度与瘘管的长短、多少是有一定关系的，新生的瘘管流脓较多，分泌物不断的刺激皮肤，出现瘙痒的症状，而且瘘管内的脓液积聚也会出现肿胀疼痛，甚至会引起发烧，而且瘘管外口排出的脓液一般是血性有粘稠性的，比较深的高位肛瘘，还会有粪便和气体排出。
肛瘘手术愈合周期需要一个月，一周左右就可以正常工作，主要是需要每天大便后温开水坐浴，保持伤口清洁，每天换药一次就可以了，肛瘘的治疗，保守治疗和用药是无效的，只能起到心理安慰作用没有临床效果。此病的治疗只能通过手术或者激光找到内口，切开内口才能好。
肛瘘病人在手术后，如果没有伤口感染等症状出现，一般经过半个月就可以恢复，但具体恢复时间因人而异。建议病人在术后坚持用温水坐浴，并服用消炎药物来抗感染，还要多吃富含膳食纤维的食物，以保持大便通畅，防止伤口受到不良刺激。
肛瘘是肛腺感染引起的，多由肛周脓肿破溃发展而来。肛瘘一旦确诊，应该在充分准备后及早手术治疗。病情越轻，创面越小，术中并发症越少，术后恢复越快，术后复发率越低，手术效果越好。术前应该充分完善相关检查，排除结核性肛瘘和克罗恩病性肛瘘。术后要注意保持肛周创面清洁，避免创面局部刺激，保持大便顺畅，避免腹泻便秘，避免刺激性饮食。
