手术治疗，如肛管损伤严重，若伤口深在，合并括约肌撕裂，可加做近端肠造口，不强求损伤彻底清创和一期修复。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。
可采用以下方法进行医治。清创引流术：肛管括约肌除一处断裂者外均应缝合，不可切除，先在局部清创后作横向双层缝合，且在肛管周围的骶骨前置放烟卷引流。抗感染治疗：造口远端乙状结肠和直肠应用生理盐水充分灌洗，并运用抗生素清洗，以防感染。
治疗采用下面的方法较好。清创引流术：肛门伤在局部清创时应尽可能保存组织，对齐后缝合修复，防止畸形愈合。药物治疗：肛管损伤有较大的感染风险，可适当使用抗生素等进行抗感染治疗。
外科治疗，如损伤轻，伤口小，无污染时，只需行单纯清创缝合，如损伤重，位置深应行结肠造口，伤口愈合后应定期扩张肛门和直肠，预防狭窄。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
采用以下方法治疗效果较好。抗生素治疗：脓肿大且全身症状重者，根据临床和药敏试验选择有效抗生素治疗，且需辅以支持对症治疗。抗感染治疗：造口远端乙状结肠和直肠应用生理盐水充分灌洗，并运用抗生素清洗，以防感染。