脓肿形成初期可行保守治疗包括应用针对需氧菌和灭氧菌的抗生素中药清热解毒等。脓肿一旦形成即行切开引流。脓肿大且全身症状重者除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外尚需辅以支持对症治疗。
肛周脓肿和痔疮是可以进行手术的，可以到正规医院的肛肠科进行面诊，若是目前考虑为肛周脓肿，可以到正规医院进行手术治疗，同时在平时清淡饮食，忌烟忌酒，忌刺激辛辣食物。
肛周脓肿手术是急诊手术，而痔疮手术是择期手术，所以这两种手术不一起做是对的。如果肛周脓肿好了，可以考虑痔疮手术。肛旁脓肿是肛门周围软组织间隙的化脓性感染，痔疮是直肠下段和肛门上段的静脉丛扩张形成的，两者属于不同部位的疾病，是不可以同时手术治疗的。
手术后要生活规律，注意休息，清淡饮食，避免烟酒刺激，多吃蔬菜和水果，避免油腻辛辣刺激性食物，可以多吃蔬菜和粗粮，忌海鲜牛羊肉等发物。要注意多喝水，保持大便的通畅。
肛周脓肿是因直肠炎症等蔓延到周围形成是一个浓腔，脓液较少时可以通过大剂量的消炎药治疗，但脓液较多时应该要切开引流，肛周脓肿如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。
肛周脓肿和肛瘘属于开放性的伤口，一般不做缝合，每天换药，坐浴熏洗，就能做到不感染。至于复发，和疾病和做手术有关。应该注意局部清洁卫生。防止伤口受压，尤其在睡觉时避免压倒患处。在手术后2-3天内可以吃一些流食，之后可以进食无渣或少渣的食物等。另外，手术后也就是第五天后应该注意多吃蔬菜、水果。特别注意的是不要进食辛辣刺激的食物，禁烟酒。