1、受到感染。从临床医学发现，导致肛周脓肿的原因是因为受到感染的缘故。2、抵抗力下降。人体有免疫系统，然而如果免疫系统下降就会导致病菌更轻易的侵入人体，从而导致疾病的发生。3、肛门受到刺激或损伤。当皮肤黏膜被擦伤后，粪便所携带的病菌会更加轻易的感染肝门，从而造成一系列肛门疾病的发生。4、手术原因。如果出现手术感染，或者医生在手术过程中不小心割伤肛周皮肤组织都会导致肛周疾病的发生。
常见的肛周囊肿有这三种，骨盆直肠窝脓肿又称骨盆直肠间隙脓肿，较为少见，但很重要。直肠后间隙脓肿属于肛提肌以上深部脓肿，坐骨直肠窝脓肿。治疗措施：少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式。
肛周囊肿会出现红肿热痛四大症状，可以局部发热，也可以引起全身的发热，温度最高时可达到39度以上，会感到乏力，小便困难，大便困难，排便不尽感，便意明显。平时多注意喝水。
肛周囊肿症状主要表现为疼痛，根据脓肿位置不同，表现也有所不同。盆膈肌下方脓肿位置较浅，疼痛较重且为跳痛，影响行走和下坐。盆膈肌上方脓肿位置较深、疼痛较轻，多为胀痛。排便时疼痛加剧，可伴排尿困难。肛周囊肿症状还表现为寒战、发热、头痛、周身不适、脉速等。
肛周脓肿的特征是肛周持续性剧烈疼痛呈逐渐加重。去肛肠科检查。肛周脓肿一旦发生，只有手术才能完全好，而且是应尽快手术，避免感染蔓延，发生脓毒血症、败血症而危及生命。
这种病疼痛较重，有的甚至不敢行走或坐着，一般肛周会摸到硬块，肛周皮肤红肿，压痛明显。一般首选抗炎治疗，若抗炎治疗效果欠佳则建议行脓肿切开引流术，术后继续抗炎治疗，及时换药。有时脓肿还会自行破溃而形成肛瘘。