外科治疗，如损伤轻，伤口小，无污染时，只需行单纯清创缝合，如损伤重，位置深应行结肠造口，伤口愈合后应定期扩张肛门和直肠，预防狭窄。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
脓肿形成之前或早期，可采用抗感染治疗。脓肿形成时，即应手术引流。脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗。在脓肿切开引流时，若发现明确的内口，可同时行挂线术。
采用以下治疗方法会比较好。清创引流术：肛管括约肌除一处断裂者外均应缝合，不可切除，先在局部清创后作横向双层缝合，且在肛管周围的骶骨前置放烟卷引流。近端造口术：为防止肛管修复后局部感染，于其近端作乙状结肠造口术，使其修复处能得到顺利愈合。
抗生素治疗，脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
手术治疗，肛管损伤严重，若伤口深在，合并括约肌撕裂，可加做近端肠造口，不强求损伤彻底清创和一期修复。抗生素治疗，脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗；
近端造口术：目的是为了防止肛门、肛管修复后局部感染，作乙状结肠造口术。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。