治疗肛周脓肿治疗，一般是需要及时切开引流，排出脓液，并且定期进行换药处理，以观察伤口创面的愈合情况，后期可以在每次大便之后，使用消炎溶液坐浴，另外，肛周脓肿的病人需要酌情进行抗菌素治疗，可以根据病情给予口服、肌肉注射或者静脉滴注。
轻微肛周脓肿可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等，但多数需要手术治疗，还可以采用温水坐浴进行治疗，平时保持肛门清洁，注意卧床休息，多喝水保持大便通畅，注意饮食，多吃润肠通便的食物。
如果进行性增大，形成痈，则应该就医进行局部切开引流，避免反复或加重，同时避免不良的接触和刺激，防止烟酒熬夜劳累受凉，调整好心态，避免压力过大，逐渐地改善减轻。
在肛周脓肿首选手术治疗，手术治疗分为切开排脓和另一种两种：切开排脓：是二次手术疗法的第一次手术，可排出脓液，迅速减轻症状，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行另一种方法：一次性切开整个脓腔及内口，引流通畅，配合挂线疗法。
肛周脓肿的治疗应根据不同情况选取不同的方法，中药治疗方法包括：在未成脓阶段，以消为主，通过清热解毒、软坚散结的药物使脓肿尽快消散；在成脓阶段，通过托的方法，包括补托法、透托法，使脓液尽早排出、排净，达到目的；在后期阶段，以补为主，通过补益气血，促进局部生肌长肉，尽早愈合。
患有肛周脓肿可以每天用生理盐水清洗肛门，药水坐浴，可以口服点消炎药物联合用药治疗，也可以用热毛巾热敷肛门处按摩按摩，严重时可以去医院做引流手术治疗，多吃点蔬菜水果，少吃辛辣的食物。