约2周-3周左右。每一个患者选择的治疗方法不同是影响恢复时间的主要因素之一。还有就是每个患者选择的医疗机构规模大小不同，医生的医术高低也不同，都会影响时间。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘的临床表现是外口反复流出少量的脓性分泌物或者粪水，分泌物时多时少，由于分泌的刺激可引起肛周皮肤瘙痒，有时还有气体从外口溢出。如果外口关闭，由于引流不畅可再次出现肛周脓肿的表现，如局部的红肿热痛，严重者可出现发热，乏力等全身中毒症状。
肛瘘一般是由于肛周脓肿破溃以后引起的，到正规医院肛肠科就诊，明确情况，行手术治疗，手术后需要定期清洁换药，大约需要十五天左右就可以痊愈。不要吃辛辣刺激性的食物，不要喝酒，不要抽烟。
肛瘘是需要医治，不治是不会自己好的，一般可以通过手术医治，在饮食方面要清淡，主要吃流食和易消化食物、可以多吃青菜和水果，平时还要注意局部卫生，多用清水清洗，还要多注意休息。