肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
按病变程度分类：单纯性肛瘘，只有一条瘘管，内外口直通的肛瘘；复杂性肛瘘，瘘管和外口在两条或两个以上，但内口可以是一个或多个的肛瘘。按病变的深浅分类：低位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层以下的肛瘘；高位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层或耻骨直肠肌以上，内口在齿线或齿线以上的肛瘘。
中医治疗肛瘘需要吃一些相关药物进行治疗，同时在平时生活中要注意个人卫生，养成良好的生活习惯，少吃辣以及油腻的食物，注意清淡饮食，避免熬夜劳累。必要时可以到医院检查一下。
肛瘘的治疗方法目前普遍采取手术治疗，手术是肛瘘的唯一方法，肛瘘分为单纯性和复杂性，低位和高位，手术方式也不一样，如果是高位肛瘘需要采取挂线治疗，一次性切除容易损伤肛管直肠环而引起肛门失禁等。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
肛瘘不开刀治疗的方法主要是选择使用药物以及用药物进行肛门坐浴，比如使用消炎药以及中药等药物调理，促进肛瘘瘘管内的脓液排出，消除炎症，同时配合肛门洗剂或者复方苦参洗剂进行坐浴，可以清洁肛周皮肤，避免感染加重。再配合冷冻、激光、电疗的方法进行瘘管的根除，或者选择药物进行瘘管的填塞，闭合内口。
