肛周脓肿没有成熟化脓时以抗炎及对症治疗为主，如果已化脓需及时行切开引流术。如果没有化脓可以服抗炎的药物，必要时输液抗炎，肛门经常用温水坐浴，忌烟酒及辛辣刺激食物，如果脓肿已变软有波动感，则提示已化脓，需及时去医院行切开引流手术。
肛周脓肿的人很可能复发。对于复发，应根据病情再次选择药物治疗或手术。外科治疗是目前最有效的治疗方法，可以达到快速治疗的效果。如果有手术禁忌症，也可以服用一些专业药物进行治疗。
肛周脓肿饮食清淡避免便秘，忌辛辣刺激食物，以及羊肉狗肉等发物，菠菜、芹菜、冬瓜、丝瓜、南瓜、绿豆、黄豆、油菜、黄花菜、木耳、海带、萝卜等蔬菜很清淡，且还含有较多的纤维素，能够清热解毒，经常使用这些蔬菜，能够改善肛门局部肿痛以及流脓流水的症状。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
肛周脓肿术后饮食根据肠胃肠道内环境来调控，不需要早期就控制饮食，建议做完手术后，恢复到正常饮食即可，比如可正常吃点米饭、蔬菜、肉食。早期时可适当控制，注意清淡饮食，海鲜、海产品、菌类，以及容易引起肠道不适的食物要适当控制，一般不需要对饮食有太强要求。
对于肛周脓肿这种疾病，多发于男性，就是因为男性肛腺特别发达，分泌腺体多，因此感染的机会也就增多，另外这种疾病对于身体健康具有一定影响的疾病，男性在生活之中还是具有很多不良的生活习惯的，像是很多男性都是喜欢喝酒，喜欢抽烟的，另外就是男性在生活之中工作压力可能更大些，这也可能是男性肛旁脓肿较多的原因之一。
