肛周脓肿可以考虑手术治疗，如果不积极治疗，肛周脓肿破溃后会形成肛瘘。确诊肛周脓肿后，积极手术治疗，需要应用抗生素药物，手术后积极的换药，大部分都效果不错。另外要注意保持肛门清洁。
肛周脓肿不治疗不会自己好，是由于炎症引起的，每天要用生理盐水清洗肛门，外涂点消炎止痛的药膏，严重时可以去医院做引流手术治疗，平时要多喝水，多吃点蔬菜水果，少吃油腻辛辣的食物，尽量保持大便通畅。
肛周脓肿，在各大城市三甲医院都可以治疗，如果已经出现肛周的脓肿，一般的治疗方法就是手术治疗，局麻下给予手术切开引流脓肿，将脓肿里的脓液排出，减轻肛周的疼痛、肿胀感。对脓肿内给予消毒，用碘伏、双氧水冲洗，之后放入药条，每天进行常规的换药，使脓肿能够逐渐的减小。根据肛周脓肿的病因，再进行下一步的治疗，多数都是肛瘘引起的，可能需要再次切除肛瘘。
对于肛周脓肿，西医常用的是抗生素，可以通过口服或者静脉点滴来进行治疗。
对于肛周脓肿，可以在浅浅的地方涂抹，如果是在皮肤比较浅的地方，那么就可以进行手术。反之，局部脓肿不是消失，而是扩大，或者是软化，就是已经形成了脓液，可以通过切口排脓。对于小儿肛周脓肿，父母要立即送到正规的医疗机构进行正确的处理，以促进病情的好转。上述药品需要在医生的指导下服用。
肛周脓肿是不能不治疗的。这种疾病属于急性感染性疾病，具体的又分为肛周脓肿皮下型、坐骨直肠间隙脓肿、骨盆直肠间隙脓肿。对于深部的脓肿，如果没有得到及时有效的治疗或者不治疗，感染是会逐渐加重的。