导致肛周脓肿的严重原因是肛门腺感染：肛门腺开口于肛管直肠交界处的肛窦内，肛窦呈漏斗状向上开口，易损伤及细菌的侵入而引起感染。肛窦一旦感染后，会引起感染化脓，炎症向肛周的间隙内扩散。
肛周脓肿是由于肛腺感染引起的，由于肛窦开口向上，像口袋一样，可以存留粪便，容易引起肛窦发炎，感染蔓延至肛腺后导致括约肌的肌间感染，从而引起各种类型的肛周脓肿。需要到医院就诊。
婴儿肛周脓肿可能是激素水平过高、肛门腺体数量较多、肛窦炎等原因引起的。
1.激素水平过高：婴儿患肛周脓肿的高峰期是出生后1-2个月，男宝宝患肛周脓肿的概率更高，出生3个月内的男宝宝睾酮水平较高。
2.肛门腺体数量较多：肛门腺体可分泌粘液，润滑直肠。孕期母体内雌激素水平升高，可使婴儿肛门腺体数量增多，大便次数较多。排便时细菌性稀便进入腺体，可引起感染，出现肛周脓肿。
3.肛窦炎：患儿肛门括约肌收缩时，体内炎性分泌物排泄受到影响，扩散至直肠、肛门周围时，就可能形成肛周脓肿。
肛周脓肿形成的原因多数是由于肛窦炎感染未得到及时控制，而波及到肛门直肠周围软组织，从而形成局限性脓肿。肛窦一旦感染后，会引起肛门腺感染化脓，炎症向肛周间隙内扩散形成肛周脓肿。
引起肛周脓肿的病因较多，主要原因有以下几个方面：1、感染性因素：感染是引起本病的主要原因。2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿。4、其它：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下。
