肛瘘手术恢复时间相对较长，大约需要一个月的时间才能完全恢复。判断伤口愈合情况，如果表皮愈合，可以用手轻轻按压患处，感觉皮肤下是否有积水或空洞。注意休息，注意合理饮食，少吃辛辣刺激性食物，避免烟酒，注意局部清洁干燥，保持大便通畅。
低位肛瘘手术假性愈合症状表现为瘘管会突然之间出现剧烈疼痛，脓液会有快速增加的情况，还会伴有高烧。在经过一段时间之后，会有破溃脓液流出的情况，治疗后一定要积极的去换药，及时的观察手术创面的生长状况。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
轻微肛瘘症状，流脓，肛瘘流脓的程度与瘘管的长短、多少是有一定关系的，新生的瘘管流脓较多，分泌物不断的刺激皮肤，出现瘙痒的症状，而且瘘管内的脓液积聚也会出现肿胀疼痛，甚至会引起发烧，而且瘘管外口排出的脓液一般是血性有粘稠性的，比较深的高位肛瘘，还会有粪便和气体排出。
瘘管排脓较多，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成。瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升，以后封闭的瘘口破溃，又排出脓液，也可从瘘口排出气体或粪便。