脓腔与肛瘘相通的脓肿：可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确。
肛周脓肿有保守治疗和手术治疗两种治疗方法，两种治疗效果完全不同。手术治疗是更好的一种治疗方法，可以一次性的将肛周脓肿治好。保守治疗只是对肛周脓肿进行控制，或起到减轻的作用。
轻度肛周脓肿可以用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，平时保持肛门清洁，要多食果蔬，矫正便秘，多吃燕麦、糙米等富含膳食纤维的食物，注意少吃油炸、熏烤、味香、肥美的油腻食品的。
症状会出现，肛门直肠的疼痛以及发热，直肠周围可以触及肿块伴有压痛和波动感，类似于揉动装水的气球，约半数的肛门脓肿会发展为慢性的肛瘘，就是肛管直肠与肛门皮肤相通的感染性管道。
轻度肛周脓肿，需要治疗一至两周，肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性疾病。肛周脓肿不仅会反复发作，影响肛门正常的生理功能，而且感染容易损害周围脏器。多食果蔬，多吃富含膳食纤维的食物。
肛周脓肿的主要症状是肛门疼痛。这种疼痛是持续性的，与大便无关，疼痛剧烈坐卧不安，食欲不振，发现肛门周围有肿块，或伴有排便困难等症状肛周脓肿一旦发生，只能手术可以治疗。