肛周脓肿最主要的症状是疼痛，疼痛剧烈，且逐渐加重。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛。其他症状：部分出现大小便不畅、纳差、失眠。诊断依据：肛门周围出现小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧。
对于肛周脓肿需要手术治疗才可以恢复。如果局部红肿消失，没有隆起，手术切口或破溃口完全愈合，无窦道形成，无发烧的情况，则提示可能已经有好转了。多吃新鲜蔬菜和水果，不吃辛辣食物，忌烟酒。
临床上发现肛周有巨大包块，有波动感，坠胀，无明显高热，血常规检查白细胞、中性细胞比例无显著异常者，要高度怀疑囊性疾病的可能性。肛周囊肿有明显症状时，其囊肿体积多较大，内容物为囊液，可达数百毫升。囊液以囊壁分泌物为主，多为红褐色，质地清稀，呈水样，伴细菌感染时呈黏稠脓液。
肛周脓肿是在肛周化脓，出现炎性包块，局部软组织化脓以后会引起病人非常明显的症状，就是非常的疼痛。肛周脓肿主要的发作部位是在肛门周围的间隙，所以病人能摸到局部非常明显的包块，红肿热痛非常明显，经常伴随发烧的情况，低烧在38度左右，高烧病人可以到40度，而且会出现排便不畅，影响排便甚至影响小便，出现小便不畅，所以肛周脓肿一旦发现，一定要及时就诊，而且要及时手术。
肛门周围出现小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅及里急后重等直肠刺激症状。囊肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位囊肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。